Carsten Wiuf
Professor
Institut for Matematiske Fag
Universitetsparken 5
2100 København Ø
An algebro-topological description of protein domain structure
Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Simulating haplotype blocks in the human genome
Posada, D. & Wiuf, Carsten, 1 feb. 2003, I: Bioinformatics. 19, 2, s. 289-290 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network
Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage
Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution
Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10576-10581 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum
Ratmann, O., Jørgensen, O., Hinkley, T., Stumpf, M., Richardson, S. & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2007, I: PLOS Computational Biology. 3, 11, s. 2266-2278 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
From evidence to inference: Probing the evolution of protein interaction networks
Ratmann, O., Wiuf, Carsten & Pinney, J. W., 1 okt. 2009, I: HFSP Journal. 3, 5, s. 290-306 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison
Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers
Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe
Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, , 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graphical criteria for positive solutions to linear systems
Saez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2018, I: Linear Algebra and Its Applications. 552, s. 166-193Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 1, s. 195–237Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The Coalescent of Bacterial Populations
Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models
Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics
Soraggi, S. & Wiuf, Carsten, 2019, I: Theoretical Population Biology. 125, s. 56-66 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Powerful Inference With the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data
Soraggi, S., Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 2, s. 551-566Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination analysis using directed graphical models [4]
Strimmer, K., Wiuf, Carsten & Moulton, V., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 1, s. 97-99 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks
Stumpf, M. P. H., Kelly, W. P., Thorne, T. & Wiuf, Carsten, 1 jul. 2007, I: Trends in Ecology and Evolution. 22, 7, s. 366-373 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Statistical and evolutionary analysis of biological networks
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
Statistical model selection methods applied to biological networks
Stumpf, M. P. H., Ingram, P. J., Nouvel, I. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2005, Transactions on Computational systems Biology III. s. 65-77 13 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3737 LNBI).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimating the size of the human interactome
Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Subnets of scale-free networks are not scale-free: Sampling properties of networks
Stumpf, M. P. H., Wiuf, Carsten & May, R. M., 22 mar. 2005, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102, 12, s. 4221-4224 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Incomplete and noisy network data as a percolation process
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 6 okt. 2010, I: Journal of the Royal Society Interface. 7, 51, s. 1411-1419 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Sampling properties of random graphs: The degree distribution
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2005, I: Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 72, 3, 036118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nonnegative linear elimination for chemical reaction networks
Sáez, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2019, I: SIAM Journal on Applied Mathematics. 79, 6, s. 2434-2455Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 36080139
Flest downloads
-
1288
downloads
Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
292
downloads
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
258
downloads
Identifying parameter regions for multistationarity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet