Carsten Wiuf

Carsten Wiuf

Professor

ORCID: 0000-0002-1302-4445

Udgivelsesår:
Alle
1 - 100 ud af 149Pr. side: 100
Sortering: 1. forfatter
  1. Udgivet

    Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies

    van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. The effects of incomplete protein interaction data on structural and evolutionary inferences

    de Silva, E., Thorne, T., Ingram, P., Agrafioti, I., Swire, J., Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 3 nov. 2006, I: BMC Biology. 4, 39.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer

    Zieger, K., Wiuf, Carsten, Jensen, K. M. E., Ørntoft, T. & Dyrskjøt, L., 16 maj 2009, I: BMC Cancer. 9, 149.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Role of activating fibroblast growth factor receptor 3 mutations in the development of bladder tumors

    Zieger, K., Dyrskjøt, L., Wiuf, Carsten, Jensen, J. L., Andersen, C. L., Jensen, K. M. E. & Ørntoft, T. F., 1 nov. 2005, I: Clinical Cancer Research. 11, 21, s. 7709-7719 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Full classification of dynamics for one-dimensional continuous-Time Markov chains with polynomial transition rates

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2023, I: Advances in Applied Probability. 55, 1, s. 321-355

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Structural classification of continuous time Markov chains with applications

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Stochastics. 94, 7, s. 1003-1030

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    The asymptotic tails of limit distributions of continuous-time Markov chains

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2024, I: Advances in Applied Probability. 56, 2, s. 693–734

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    Power-Law Kinetics and Determinant Criteria for the Preclusion of Multistationarity in Networks of Interacting Species

    Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 16 okt. 2013, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 12, 4, s. 1685-1721 37 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    LandScape: a simple method to aggregate p-values and other stochastic variables without a priori grouping

    Wiuf, Carsten, Pallesen, J. S., Foldager, L. & Grove, J., aug. 2016, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 15, 4, s. 349-361

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Consistency of estimators of population scaled parameters using composite likelihood

    Wiuf, Carsten, 1 nov. 2006, I: Journal of Mathematical Biology. 53, 5, s. 821-841 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Inference on Recombination and Block Structure Using Unphased Data

    Wiuf, Carsten, 1 jan. 2004, I: Genetics. 166, 1, s. 537-545 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Conditional genealogies and the age of a neutral mutant

    Wiuf, Carsten & Donnelly, P., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 56, 2, s. 183-201 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Some notes on the combinatorial properties of haplotype tagging

    Wiuf, Carsten, Laidlaw, Z. & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2003, I: Mathematical Biosciences. 185, 2, s. 205-216 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Evolutionary analysis of protein interaction networks

    Wiuf, Carsten & Ratmann, O., 1 jan. 2009, Statistical and Evolutionary Analysis of Biological Networks. Imperial College Press, s. 17-43 27 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  15. Recombination as a point process along sequences

    Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 55, 3, s. 248-259 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research

    Wiuf, Carsten & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Oxford University Press. 208 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    A reaction network scheme for hidden Markov model parameter learning

    Wiuf, Carsten, Behera, A., Singh, A. & Gopalkrishnan, M., 2023, I: Journal of the Royal Society Interface. 20, 203, 20220877.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. The probability and chromosomal extent of trans-specific polymorphism

    Wiuf, Carsten, Zhao, K., Innan, H. & Nordborg, M., 1 dec. 2004, I: Genetics. 168, 4, s. 2363-2372 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. A coalescence approach to gene conversion

    Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 57, 4, s. 357-367 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. The ancestry of a sample of sequences subject to recombination

    Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 mar. 1999, I: Genetics. 151, 3, s. 1217-1228 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. The coalescent with gene conversion

    Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 maj 2000, I: Genetics. 155, 1, s. 451-462 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. A coalescent model of recombination hotspots

    Wiuf, Carsten & Posada, D., 1 maj 2003, I: Genetics. 164, 1, s. 407-417 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    Some properties of the conditioned reconstructed process with Bernoulli sampling

    Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Theoretical Population Biology. 122, s. 36-45 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Methods for derivation of LOH and allelic copy numbers using SNP arrays

    Wiuf, Carsten, Lamy, P. & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University Press, Bind 9780199532872.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  25. On the number of ancestors to a DNA sequence

    Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 nov. 1997, I: Genetics. 147, 3, s. 1459-1468 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Binomial subsampling

    Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2006, I: Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences. 462, 2068, s. 1181-1195 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Inferring population history from genealogical trees

    Wiuf, Carsten, 1 mar. 2003, I: Journal of Mathematical Biology. 46, 3, s. 241-264 24 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. A simulation study of the reliability of recombination detection methods

    Wiuf, Carsten, Christensen, T. & Hein, J., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 10, s. 1929-1939 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Recombination in human mitochondrial DNA?

    Wiuf, Carsten, 17 nov. 2001, I: Genetics. 159, 2, s. 749-756 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. On the minimum number of topologies explaining a sample of DNA sequences

    Wiuf, Carsten, 1 dec. 2002, I: Theoretical Population Biology. 62, 4, s. 357-363 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Rare alleles and selection

    Wiuf, Carsten, 1 jan. 2001, I: Theoretical Population Biology. 59, 4, s. 287-296 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. A likelihood approach to analysis of network data

    Wiuf, Carsten, Brameier, M., Hagberg, O. & Stumpf, M. P. H., 16 maj 2006, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 20, s. 7566-7570 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Algebraic Statistics and Methods in Systems Biology

    Wiuf, Carsten, 12 sep. 2011, Handbook of Statistical Systems Biology. Wiley, s. 114-132 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  34. On the genealogy of a sample of neutral rare alleles

    Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 58, 1, s. 61-75 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Do ΔF508 heterozygotes have a selective advantage?

    Wiuf, Carsten, 29 aug. 2001, I: Genetical Research. 78, 1, s. 41-47 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. High-resolution melting analysis for mutation screening of RGSL1, RGS16, and RGS8 in breast cancer

    Wiechec, E., Wiuf, Carsten, Overgaard, J. & Hansen, L. L., 1 feb. 2011, I: Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 20, 2, s. 397-407 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics

    Widder, S., Allen, R. J., Pfeiffer, T., Curtis, T. P., Wiuf, C. H., Sloan, W. T., Cordero, O. X., Brown, S. P., Momeni, B., Shou, W., Kettle, H., Flint, H. J., Haas, A. F., Laroche, B., Kreft, J-U., Rainey, P. B., Freilich, S., Schuster, S., Milferstedt, K., van der Meer, J. R. & 10 flere, Groβkopf, T., Huisman, J., Free, A., Picioreanu, C., Quince, C., Klapper, I., Labarthe, S., Smets, B. F., Wang, H. & Soyer, O. S., 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2557-2568 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data

    Wang, K., Li, J., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 9 jan. 2009, I: BMC Bioinformatics. 10, 12.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Identification of hidden population structure in time-scaled phylogenies

    Volz, E. M., Wiuf, Carsten, Grad, Y. H., Frost, S. D. W., Dennis, A. M. & Didelot, X., 2020, I: Systematic Biology. 69, 5, s. 884-896

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data

    Vincent, M., Mundbjerg, K., Pedersen, J. S., Liang, G., Jones, P. A., Orntoft, T. F., Sorensen, K. D. & Wiuf, Carsten, 21 feb. 2017, I: Genome Biology (Online Edition). 18, 38.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Identification of endogenous retroviral reading frames in the human genome

    Villesen, P., Aagaard, L., Wiuf, Carsten & Pedersen, F. S., 11 okt. 2004, I: Retrovirology. 1, 32.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model

    Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Genome-wide analysis of allelic imbalance in prostate cancer using the Affymetrix 50K SNP mapping array

    Tørring, N., Borre, M., Sørensen, K. D., Andersen, C. L., Wiuf, Carsten & Ørntoft, T. F., 12 feb. 2007, I: British Journal of Cancer. 96, 3, s. 499-506 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer

    Toustrup, K., Sørensen, B. S., Nordsmark, M., Busk, M., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 1 sep. 2011, I: Cancer Research. 71, 17, s. 5923-5931 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Gene expression classifier predicts for hypoxic modification of radiotherapy with nimorazole in squamous cell carcinomas of the head and neck

    Toustrup, K., Sørensen, B. S., Lassen, P., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 2012, I: Radiotherapy & Oncology. 102, 1, s. 122-129 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes

    Tidow, H., Poulsen, L. R., Andreeva, A., Knudsen, M., Hein, K. L., Wiuf, Carsten, Palmgren, Michael & Nissen, P., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 468–472 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  47. Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis

    Thorsen, K., Schepeler, T., Øster, B., Rasmussen, M. H., Vang, S., Wang, K., Hansen, K. Q., Lamy, P., Pedersen, J. S., Eller, A., Mansilla, F., Laurila, K., Wiuf, Carsten, Laurberg, S., Dyrskjøt, L., Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 14 okt. 2011, I: BMC Genomics. 12, 505.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. SNPTools: A software tool for visualization and analysis of microarray data

    Sørensen, F. J., Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 15 jun. 2007, I: Bioinformatics. 23, 12, s. 1550-1552 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Nonnegative linear elimination for chemical reaction networks

    Sáez, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2019, I: SIAM Journal on Applied Mathematics. 79, 6, s. 2434-2455

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Linear elimination in chemical reaction networks

    Sáez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2019, Recent Advances in Differential Equations and Applications. Guirao, J. L. G., Hernández, J. A. M. & Esparza, F. P. (red.). Springer, s. 177-193 17 s. (SEMA SIMAI Springer Series, Bind 18).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  51. Udgivet

    Estimating the size of the human interactome

    Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. Subnets of scale-free networks are not scale-free: Sampling properties of networks

    Stumpf, M. P. H., Wiuf, Carsten & May, R. M., 22 mar. 2005, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102, 12, s. 4221-4224 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  53. Incomplete and noisy network data as a percolation process

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 6 okt. 2010, I: Journal of the Royal Society Interface. 7, 51, s. 1411-1419 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  54. Sampling properties of random graphs: The degree distribution

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2005, I: Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 72, 3, 036118.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Statistical and evolutionary analysis of biological networks

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

  56. Statistical model selection methods applied to biological networks

    Stumpf, M. P. H., Ingram, P. J., Nouvel, I. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2005, Transactions on Computational systems Biology III. s. 65-77 13 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3737 LNBI).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  57. Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks

    Stumpf, M. P. H., Kelly, W. P., Thorne, T. & Wiuf, Carsten, 1 jul. 2007, I: Trends in Ecology and Evolution. 22, 7, s. 366-373 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  58. Recombination analysis using directed graphical models [4]

    Strimmer, K., Wiuf, Carsten & Moulton, V., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 1, s. 97-99 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  59. Udgivet

    General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics

    Soraggi, S. & Wiuf, Carsten, 2019, I: Theoretical Population Biology. 125, s. 56-66 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  60. Udgivet

    Powerful Inference With the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data

    Soraggi, S., Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 2, s. 551-566

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  61. Udgivet

    A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models

    Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  62. The Coalescent of Bacterial Populations

    Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  63. Udgivet

    Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species

    Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 1, s. 195–237

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  64. Udgivet

    Graphical criteria for positive solutions to linear systems

    Saez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2018, I: Linear Algebra and Its Applications. 552, s. 166-193

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  65. Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe

    Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, Breuer, R., Czerski, P. M., Giegling, I., Strengman, E., Schmael, C., Mors, O., Mortensen, P. B., Hougaard, D. M., Orntoft, T., Kapelski, P., Priebe, L., Basmanav, F. B., Forstner, A. J., Hoffmann, P. F. F., Meier, S., Nikitopoulos, J., Moebus, S., Alexander, M., Mössner, R., Wichmann, H., Schreiber, S., Rivandeneira, F., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Wienker, T. F., Schumacher, J., Hauser, J., Maier, W., Cantor, R., Erk, S., Schulze, T. G., Stefansson, H., Steinberg, S., Gustafsson, O., Sigurdsson, E., Petursson, H., Kong, A., Stefansson, K., Pietiläinen, O. P. H., Tuulio-Henriksson, A., Paunio, T., Lonnqvist, J., Suvisaari, J., Peltonen, L., Ruggeri, M., Tosato, S., Walshe, M., Murray, R., Collier, D. A., Clair, D. S., Hansen, T., Ingason, A., Jakobsen, K. D., Duong, L., Werge, T., Melle, I., Andreassen, O. A., Djurovic, S., Bitter, I., Réthelyi, J. M., Abramova, L., Kaleda, V., Golimbet, V., Jönsson, E. G., Terenius, L., Agartz, I., Winkel, R. V., Kenis, G., Hert, M. D., Veldink, J., Wiuf, Carsten, Didriksen, M., Craddock, N., Owen, M. J., O'Donovan, M. C., Børglum, A., Rujescu, D., Walter, H., Meyer-Lindenberg, A., Nöthen, M. M., Ophoff, R. A. & Cichon, S., 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  66. Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers

    Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  67. Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10576-10581 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  68. Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum

    Ratmann, O., Jørgensen, O., Hinkley, T., Stumpf, M., Richardson, S. & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2007, I: PLOS Computational Biology. 3, 11, s. 2266-2278 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  69. From evidence to inference: Probing the evolution of protein interaction networks

    Ratmann, O., Wiuf, Carsten & Pinney, J. W., 1 okt. 2009, I: HFSP Journal. 3, 5, s. 290-306 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  70. Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  71. Udgivet

    Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage

    Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  72. Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network

    Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  73. Simulating haplotype blocks in the human genome

    Posada, D. & Wiuf, Carsten, 1 feb. 2003, I: Bioinformatics. 19, 2, s. 289-290 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  74. An algebro-topological description of protein domain structure

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  75. Fatgraph models of proteins

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 1 okt. 2010, I: Communications on Pure and Applied Mathematics. 63, 10, s. 1249-1297 49 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  76. Udgivet

    Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression

    Pedersen, B. P., Ifrim, G., Liboriussen, P., Axelsen, K. B., Palmgren, Michael, Nissen, P., Wiuf, Carsten & Pedersen, C. N. S., 20 jan. 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 11 s., e85139.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  77. A codon-based model designed to describe lentiviral evolution

    Pedersen, A. M. K., Wiuf, Carsten & Christiansen, F. B., 1 jan. 1998, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 15, 8, s. 1069-1081 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  78. Udgivet

    Parchment Glutamine Index (PQI): A novel method to estimate glutamine deamidation levels in parchment collagen obtained from low-quality MALDI-TOF data

    Anila Bhuvanendran Nair, Bharath, Palomo, I. R., Markussen, Bo, Wiuf, Carsten, Fiddyment, S. & Collins, Matthew James, 2023, I: Peer Community Journal. 3, 18 s., e10.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  79. Udgivet

    Intermediates and Generic Convergence to Equilibria

    Marcondes de Freitas, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Bulletin of Mathematical Biology. 79, 7, s. 1662–1686

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  80. Udgivet

    Intermediates, Catalysts, Persistence, and Boundary Steady States

    Marcondes de Freitas, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 4, s. 887–932

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  81. Udgivet

    Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

    Mahdi, A., Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2213-2232

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  82. Germline mutation in RNASEL predicts increased risk of head and neck, uterine cervix and breast cancer

    Madsen, B. E., Ramos, E. M., Boulard, M., Duda, K., Overgaard, J., Nordsmark, M., Wiuf, Carsten & Hansen, L. L., 25 jun. 2008, I: PLOS ONE. 3, 6, e2492.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  83. Short tandem repeats in human exons: A target for disease mutations

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 12 sep. 2008, I: BMC Genomics. 9, 410.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  84. A periodic pattern of SNPs in the human genome

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2007, I: Genome Research. 17, 10, s. 1414-1419 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  85. Short tandem repeats and genetic variation

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, Genetic Variation: Methods and Protocols. Humana Press, s. 297-306 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 628).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  86. Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin

    Li, J., Wang, K., Jensen, T. D., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 29 nov. 2010, I: BMC Research Notes. 3, 321.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  87. A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

    Laurila, K., Oster, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, Carsten, 27 maj 2011, I: BMC Bioinformatics. 12, 215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  88. Genotyping and annotation of Affymetrix SNP arrays

    Lamy, P., Andersen, C. L., Wikman, F. P. & Wiuf, Carsten, 21 sep. 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 14, e100.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  89. A Hidden Markov Model to estimate population mixture and allelic copy-numbers in cancers using Affymetrix SNP arrays

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjot, L., Torring, N. & Wiuf, Carsten, 9 nov. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 434.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  90. Rseg-an R package to optimize segmentation of SNP array data

    Lamy, P., Wiuf, Carsten, Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 1 feb. 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 419-420 2 s., btq668.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  91. A review of software for microarray genotyping

    Lamy, P., Grove, J. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2011, I: Human Genomics. 5, 4, s. 304-309 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  92. Are microRNAs located in genomic regions associated with cancer?

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjøt, L., Tørring, N., Ørntoft, T. & Wiuf, Carsten, 20 nov. 2006, I: British Journal of Cancer. 95, 10, s. 1415-1418 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  93. Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM

    Kristensen, L. S., Wojdacz, T. K., Thestrup, B. B., Wiuf, Carsten, Hager, H. & Hansen, L. L., 21 dec. 2009, I: BMC Cancer. 9, 453.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  94. Udgivet

    Phosphorelays provide tunable signal processing capabilities for the cell

    Kothamachu, V. B., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten, Cardelli, L. & Soyer, O. S., 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 11, s. e1003322

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  95. High-density single nucleotide polymorphism array defines novel stage and location-dependent allelic imbalances in human bladder tumors

    Koed, K., Wiuf, Carsten, Christensen, L. L., Wikman, F. P., Zieger, K., Møller, K., Von Der Maase, H. & Ørntoft, T. F., 1 jan. 2005, I: Cancer Research. 65, 1, s. 34-45 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  96. Udgivet

    Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models

    Knudsen, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 300, s. 7-18 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  97. A Markov chain approach to randomly grown graphs

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 9 jul. 2008, I: Journal of Applied Mathematics. 2008, 190836.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  98. The CATH database.

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, I: Human Genomics. 4, 3, s. 207-212 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  99. Udgivet

    Phosphorelay of non-orthodox two component systems functions through a bi-molecular mechanism in vivo: the case of ArcB

    Jovanovic, G., Sheng, X., Ale, A., Feliu, Elisenda, Harrington, H. A., Kirk, P., Wiuf, Carsten, Buck, M. & Stumpf, M. P. H., 23 mar. 2015, I: Molecular BioSystems. 11, s. 1348-1359

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  100. Bounded coordinate-descent for biological sequence classification in high dimensional predictor space

    Ifrim, G. & Wiuf, Carsten, 16 sep. 2011, Proceedings of the 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD'11. s. 708-716 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 36080139