Carsten Wiuf
Professor
Institut for Matematiske Fag
Universitetsparken 5
2100 København Ø
- Udgivet
Preclusion of switch behavior in networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2012, I: Applied Mathematics and Computation. 219, 4, s. 1449-1467 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Preface
Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University PressPublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Forord/efterskrift › Forskning
- Udgivet
Product-Form Poisson-Like Distributions and Complex Balanced Reaction Systems
Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2016, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 76, 1, s. 411-432Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM
Kristensen, L. S., Wojdacz, T. K., Thestrup, B. B., Wiuf, Carsten, Hager, H. & Hansen, L. L., 21 dec. 2009, I: BMC Cancer. 9, 453.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Quasi-steady state and singular perturbation reduction for reaction networks with non-interacting species
Feliu, Elisenda, Lax, C., Walcher, S. & Wiuf, Carsten, 2022, I: SIAM Journal on Applied Dynamical Systems. 21, 2, s. 782–816Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Rare alleles and selection
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2001, I: Theoretical Population Biology. 59, 4, s. 287-296 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination analysis using directed graphical models [4]
Strimmer, K., Wiuf, Carsten & Moulton, V., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 1, s. 97-99 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Recombination as a point process along sequences
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 55, 3, s. 248-259 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination in human mitochondrial DNA?
Wiuf, Carsten, 17 nov. 2001, I: Genetics. 159, 2, s. 749-756 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison
Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Role of activating fibroblast growth factor receptor 3 mutations in the development of bladder tumors
Zieger, K., Dyrskjøt, L., Wiuf, Carsten, Jensen, J. L., Andersen, C. L., Jensen, K. M. E. & Ørntoft, T. F., 1 nov. 2005, I: Clinical Cancer Research. 11, 21, s. 7709-7719 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Rseg-an R package to optimize segmentation of SNP array data
Lamy, P., Wiuf, Carsten, Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 1 feb. 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 419-420 2 s., btq668.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SNPTools: A software tool for visualization and analysis of microarray data
Sørensen, F. J., Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 15 jun. 2007, I: Bioinformatics. 23, 12, s. 1550-1552 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SOX4 expression in bladder carcinoma: Clinical aspects and in vitro functional characterization
Aaboe, M., Birkenkamp-Demtroder, K., Wiuf, Carsten, Sørensen, F. B., Thykjaer, T., Sauter, G., Jensen, K. M. E., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T., 1 apr. 2006, I: Cancer Research. 66, 7, s. 3434-3442 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Sampling properties of random graphs: The degree distribution
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2005, I: Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 72, 3, 036118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Short tandem repeats and genetic variation
Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, Genetic Variation: Methods and Protocols. Humana Press, s. 297-306 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 628).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Short tandem repeats in human exons: A target for disease mutations
Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 12 sep. 2008, I: BMC Genomics. 9, 410.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signaling cascades: consequences of varying substrate and phosphatase levels
Feliu, Elisenda, Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Advances in Experimental Medicine and Biology. 736, s. 81-94 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simplifying biochemical models with intermediate species
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of the Royal Society. Interface. 10, 87, s. 20130484Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Simulating haplotype blocks in the human genome
Posada, D. & Wiuf, Carsten, 1 feb. 2003, I: Bioinformatics. 19, 2, s. 289-290 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Some notes on the combinatorial properties of haplotype tagging
Wiuf, Carsten, Laidlaw, Z. & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2003, I: Mathematical Biosciences. 185, 2, s. 205-216 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Some properties of the conditioned reconstructed process with Bernoulli sampling
Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Theoretical Population Biology. 122, s. 36-45 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Stationary distributions of systems with discreteness-induced transitions
Bibbona, E., Kim, J. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Journal of the Royal Society Interface. 17, 168, 11 s., 20200243.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Statistical alignment: Computational properties, homology testing and goodness-of-fit
Hein, J., Wiuf, Carsten, Knudsen, B., Møller, M. B. & Wibling, G., 8 sep. 2000, I: Journal of Molecular Biology. 302, 1, s. 265-279 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Statistical and evolutionary analysis of biological networks
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
Statistical model selection methods applied to biological networks
Stumpf, M. P. H., Ingram, P. J., Nouvel, I. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2005, Transactions on Computational systems Biology III. s. 65-77 13 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3737 LNBI).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research
Wiuf, Carsten & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Oxford University Press. 208 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural classification of continuous time Markov chains with applications
Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Stochastics. 94, 7, s. 1003-1030Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Subnets of scale-free networks are not scale-free: Sampling properties of networks
Stumpf, M. P. H., Wiuf, Carsten & May, R. M., 22 mar. 2005, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102, 12, s. 4221-4224 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network
Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The CATH database.
Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, I: Human Genomics. 4, 3, s. 207-212 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The Coalescent of Bacterial Populations
Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
The ancestry of a sample of sequences subject to recombination
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 mar. 1999, I: Genetics. 151, 3, s. 1217-1228 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The association between genetic variants in hMLH1 and hMSH2 and the development of sporadic colorectal cancer in the Danish population
Christensen, L. L., Madsen, B. E., Wikman, F. P., Wiuf, Carsten, Koed, K., Tjønneland, A., Olsen, A., Syvänen, A. C., Andersen, C. L. & Ørntoft, T. F., 11 jun. 2008, I: BMC Medical Genetics. 9, 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The asymptotic tails of limit distributions of continuous-time Markov chains
Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2024, I: Advances in Applied Probability. 56, 2, s. 693–734Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The coalescent with gene conversion
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 maj 2000, I: Genetics. 155, 1, s. 451-462 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The dynamics of stochastic mono-molecular reaction systems in stochastic environments
Cappelletti, D., Pal Majumder, A. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Stochastic Processes and Their Applications. 137, s. 106-148Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The effects of incomplete protein interaction data on structural and evolutionary inferences
de Silva, E., Thorne, T., Ingram, P., Agrafioti, I., Swire, J., Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 3 nov. 2006, I: BMC Biology. 4, 39.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The genealogy, site frequency spectrum and ages of two nested mutant alleles
Hobolth, A. & Wiuf, Carsten, 1 jun. 2009, I: Theoretical Population Biology. 75, 4, s. 260-265 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The probability and chromosomal extent of trans-specific polymorphism
Wiuf, Carsten, Zhao, K., Innan, H. & Nordborg, M., 1 dec. 2004, I: Genetics. 168, 4, s. 2363-2372 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin
Li, J., Wang, K., Jensen, T. D., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 29 nov. 2010, I: BMC Research Notes. 3, 321.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis
Thorsen, K., Schepeler, T., Øster, B., Rasmussen, M. H., Vang, S., Wang, K., Hansen, K. Q., Lamy, P., Pedersen, J. S., Eller, A., Mansilla, F., Laurila, K., Wiuf, Carsten, Laurberg, S., Dyrskjøt, L., Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 14 okt. 2011, I: BMC Genomics. 12, 505.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Two variance results in population genetics theory
Ewens, W. J., Choudhury, A. R., Lewontin, R. C. & Wiuf, Carsten, 1 apr. 2007, I: Mathematical Population Studies. 14, 2, s. 93-110 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Uniform Approximation of Solutions by Elimination of Intermediate Species in Deterministic Reaction Networks
Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2259-2286Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum
Ratmann, O., Jørgensen, O., Hinkley, T., Stumpf, M., Richardson, S. & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2007, I: PLOS Computational Biology. 3, 11, s. 2266-2278 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Utilization of computer science for construction and characterization of DNA nano-structures
Andersen, F. F., Villesen, P., Knudsen, B., Wiuf, Carsten, Desideri, A. & Knudsen, B. R., 1 dec. 2011, DNA Microarrays, Synthesis and Synthetic DNA. Nova Science Publishers, s. 317-330 14 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variable elimination in chemical reaction networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 72, 4, s. 959–981 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variable elimination in post-translational modification reaction networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of Mathematical Biology. 66, 1-2, s. 281-310Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data
Vincent, M., Mundbjerg, K., Pedersen, J. S., Liang, G., Jones, P. A., Orntoft, T. F., Sorensen, K. D. & Wiuf, Carsten, 21 feb. 2017, I: Genome Biology (Online Edition). 18, 38.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 36080139
Flest downloads
-
1287
downloads
Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
292
downloads
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
258
downloads
Identifying parameter regions for multistationarity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet