Carsten Wiuf
Professor
Institut for Matematiske Fag
Universitetsparken 5
2100 København Ø
- 1997
On the number of ancestors to a DNA sequence
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 nov. 1997, I: Genetics. 147, 3, s. 1459-1468 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1998
A codon-based model designed to describe lentiviral evolution
Pedersen, A. M. K., Wiuf, Carsten & Christiansen, F. B., 1 jan. 1998, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 15, 8, s. 1069-1081 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 1999
Conditional genealogies and the age of a neutral mutant
Wiuf, Carsten & Donnelly, P., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 56, 2, s. 183-201 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination as a point process along sequences
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 55, 3, s. 248-259 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The ancestry of a sample of sequences subject to recombination
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 mar. 1999, I: Genetics. 151, 3, s. 1217-1228 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2000
A coalescence approach to gene conversion
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 57, 4, s. 357-367 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
On the genealogy of a sample of neutral rare alleles
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 58, 1, s. 61-75 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The coalescent with gene conversion
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 maj 2000, I: Genetics. 155, 1, s. 451-462 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Statistical alignment: Computational properties, homology testing and goodness-of-fit
Hein, J., Wiuf, Carsten, Knudsen, B., Møller, M. B. & Wibling, G., 8 sep. 2000, I: Journal of Molecular Biology. 302, 1, s. 265-279 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2001
A simulation study of the reliability of recombination detection methods
Wiuf, Carsten, Christensen, T. & Hein, J., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 10, s. 1929-1939 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Rare alleles and selection
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2001, I: Theoretical Population Biology. 59, 4, s. 287-296 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination analysis using directed graphical models [4]
Strimmer, K., Wiuf, Carsten & Moulton, V., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 1, s. 97-99 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Do ΔF508 heterozygotes have a selective advantage?
Wiuf, Carsten, 29 aug. 2001, I: Genetical Research. 78, 1, s. 41-47 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination in human mitochondrial DNA?
Wiuf, Carsten, 17 nov. 2001, I: Genetics. 159, 2, s. 749-756 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2002
On the minimum number of topologies explaining a sample of DNA sequences
Wiuf, Carsten, 1 dec. 2002, I: Theoretical Population Biology. 62, 4, s. 357-363 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2003
Some notes on the combinatorial properties of haplotype tagging
Wiuf, Carsten, Laidlaw, Z. & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2003, I: Mathematical Biosciences. 185, 2, s. 205-216 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Simulating haplotype blocks in the human genome
Posada, D. & Wiuf, Carsten, 1 feb. 2003, I: Bioinformatics. 19, 2, s. 289-290 2 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Inferring population history from genealogical trees
Wiuf, Carsten, 1 mar. 2003, I: Journal of Mathematical Biology. 46, 3, s. 241-264 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A coalescent model of recombination hotspots
Wiuf, Carsten & Posada, D., 1 maj 2003, I: Genetics. 164, 1, s. 407-417 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2004
Inference on Recombination and Block Structure Using Unphased Data
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2004, I: Genetics. 166, 1, s. 537-545 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of endogenous retroviral reading frames in the human genome
Villesen, P., Aagaard, L., Wiuf, Carsten & Pedersen, F. S., 11 okt. 2004, I: Retrovirology. 1, 32.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The probability and chromosomal extent of trans-specific polymorphism
Wiuf, Carsten, Zhao, K., Innan, H. & Nordborg, M., 1 dec. 2004, I: Genetics. 168, 4, s. 2363-2372 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2005
High-density single nucleotide polymorphism array defines novel stage and location-dependent allelic imbalances in human bladder tumors
Koed, K., Wiuf, Carsten, Christensen, L. L., Wikman, F. P., Zieger, K., Møller, K., Von Der Maase, H. & Ørntoft, T. F., 1 jan. 2005, I: Cancer Research. 65, 1, s. 34-45 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Subnets of scale-free networks are not scale-free: Sampling properties of networks
Stumpf, M. P. H., Wiuf, Carsten & May, R. M., 22 mar. 2005, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102, 12, s. 4221-4224 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Sampling properties of random graphs: The degree distribution
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2005, I: Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 72, 3, 036118.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Role of activating fibroblast growth factor receptor 3 mutations in the development of bladder tumors
Zieger, K., Dyrskjøt, L., Wiuf, Carsten, Jensen, J. L., Andersen, C. L., Jensen, K. M. E. & Ørntoft, T. F., 1 nov. 2005, I: Clinical Cancer Research. 11, 21, s. 7709-7719 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Statistical model selection methods applied to biological networks
Stumpf, M. P. H., Ingram, P. J., Nouvel, I. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2005, Transactions on Computational systems Biology III. s. 65-77 13 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3737 LNBI).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
- 2006
Binomial subsampling
Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2006, I: Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences. 462, 2068, s. 1181-1195 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SOX4 expression in bladder carcinoma: Clinical aspects and in vitro functional characterization
Aaboe, M., Birkenkamp-Demtroder, K., Wiuf, Carsten, Sørensen, F. B., Thykjaer, T., Sauter, G., Jensen, K. M. E., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T., 1 apr. 2006, I: Cancer Research. 66, 7, s. 3434-3442 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A likelihood approach to analysis of network data
Wiuf, Carsten, Brameier, M., Hagberg, O. & Stumpf, M. P. H., 16 maj 2006, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 20, s. 7566-7570 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Convergence properties of the degree distribution of some growing network models
Hagberg, O. & Wiuf, Carsten, 1 aug. 2006, I: Bulletin of Mathematical Biology. 68, 6, s. 1275-1291 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genotyping and annotation of Affymetrix SNP arrays
Lamy, P., Andersen, C. L., Wikman, F. P. & Wiuf, Carsten, 21 sep. 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 14, e100.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Consistency of estimators of population scaled parameters using composite likelihood
Wiuf, Carsten, 1 nov. 2006, I: Journal of Mathematical Biology. 53, 5, s. 821-841 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The effects of incomplete protein interaction data on structural and evolutionary inferences
de Silva, E., Thorne, T., Ingram, P., Agrafioti, I., Swire, J., Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 3 nov. 2006, I: BMC Biology. 4, 39.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Are microRNAs located in genomic regions associated with cancer?
Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjøt, L., Tørring, N., Ørntoft, T. & Wiuf, Carsten, 20 nov. 2006, I: British Journal of Cancer. 95, 10, s. 1415-1418 4 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2007
Frequent occurrence of uniparental disomy in colorectal cancer
Andersen, C. L., Wiuf, Carsten, Kruhøffer, M., Korsgaard, M., Laurberg, S. & Ørntoft, T. F., 1 jan. 2007, I: Carcinogenesis. 28, 1, s. 38-48 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genome-wide analysis of allelic imbalance in prostate cancer using the Affymetrix 50K SNP mapping array
Tørring, N., Borre, M., Sørensen, K. D., Andersen, C. L., Wiuf, Carsten & Ørntoft, T. F., 12 feb. 2007, I: British Journal of Cancer. 96, 3, s. 499-506 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Co-clustering and visualization of gene expression data and gene ontology terms for Saccharomyces cerevisiae using self-organizing maps
Brameier, M. & Wiuf, Carsten, 1 apr. 2007, I: Journal of Biomedical Informatics. 40, 2, s. 160-173 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Two variance results in population genetics theory
Ewens, W. J., Choudhury, A. R., Lewontin, R. C. & Wiuf, Carsten, 1 apr. 2007, I: Mathematical Population Studies. 14, 2, s. 93-110 18 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SNPTools: A software tool for visualization and analysis of microarray data
Sørensen, F. J., Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 15 jun. 2007, I: Bioinformatics. 23, 12, s. 1550-1552 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks
Stumpf, M. P. H., Kelly, W. P., Thorne, T. & Wiuf, Carsten, 1 jul. 2007, I: Trends in Ecology and Evolution. 22, 7, s. 366-373 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
A periodic pattern of SNPs in the human genome
Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2007, I: Genome Research. 17, 10, s. 1414-1419 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum
Ratmann, O., Jørgensen, O., Hinkley, T., Stumpf, M., Richardson, S. & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2007, I: PLOS Computational Biology. 3, 11, s. 2266-2278 13 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A Hidden Markov Model to estimate population mixture and allelic copy-numbers in cancers using Affymetrix SNP arrays
Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjot, L., Torring, N. & Wiuf, Carsten, 9 nov. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 434.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Conflicting results in SNP genotype assessment
Hansen, L. L., Madsen, B. E., Pedersen, K. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2007, I: BioTechniques. 43, 6, s. 756-762 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Ab initio identification of human microRNAs based on structure motifs
Brameier, M. & Wiuf, Carsten, 18 dec. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 478.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
Importance sampling for the infinite sites model
Hobolth, A., Uyenoyama, M. K. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2008, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 7, 1, 32.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Bioinformatic identification of FGF, p38-MAPK, and calcium signalling pathways associated with carcinoma in situ in the urinary bladder
Herbsleb, M., Christensen, O. F., Thykjaer, T., Wiuf, Carsten, Borre, M., Ørntoft, T. F. & Dyrskjøt, L., 31 jan. 2008, I: BMC Cancer. 8, 37.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Estimating the size of the human interactome
Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The association between genetic variants in hMLH1 and hMSH2 and the development of sporadic colorectal cancer in the Danish population
Christensen, L. L., Madsen, B. E., Wikman, F. P., Wiuf, Carsten, Koed, K., Tjønneland, A., Olsen, A., Syvänen, A. C., Andersen, C. L. & Ørntoft, T. F., 11 jun. 2008, I: BMC Medical Genetics. 9, 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 36080139
Flest downloads
-
1285
downloads
Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
292
downloads
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
254
downloads
Identifying parameter regions for multistationarity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet