Carsten Wiuf
Professor
Institut for Matematiske Fag
Universitetsparken 5
2100 København Ø
- Udgivet
Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies
van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The effects of incomplete protein interaction data on structural and evolutionary inferences
de Silva, E., Thorne, T., Ingram, P., Agrafioti, I., Swire, J., Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 3 nov. 2006, I: BMC Biology. 4, 39.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer
Zieger, K., Wiuf, Carsten, Jensen, K. M. E., Ørntoft, T. & Dyrskjøt, L., 16 maj 2009, I: BMC Cancer. 9, 149.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Role of activating fibroblast growth factor receptor 3 mutations in the development of bladder tumors
Zieger, K., Dyrskjøt, L., Wiuf, Carsten, Jensen, J. L., Andersen, C. L., Jensen, K. M. E. & Ørntoft, T. F., 1 nov. 2005, I: Clinical Cancer Research. 11, 21, s. 7709-7719 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Full classification of dynamics for one-dimensional continuous-Time Markov chains with polynomial transition rates
Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2023, I: Advances in Applied Probability. 55, 1, s. 321-355Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Structural classification of continuous time Markov chains with applications
Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Stochastics. 94, 7, s. 1003-1030Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
The asymptotic tails of limit distributions of continuous-time Markov chains
Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2024, I: Advances in Applied Probability. 56, 2, s. 693–734Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Power-Law Kinetics and Determinant Criteria for the Preclusion of Multistationarity in Networks of Interacting Species
Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 16 okt. 2013, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 12, 4, s. 1685-1721 37 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
LandScape: a simple method to aggregate p-values and other stochastic variables without a priori grouping
Wiuf, Carsten, Pallesen, J. S., Foldager, L. & Grove, J., aug. 2016, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 15, 4, s. 349-361Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Consistency of estimators of population scaled parameters using composite likelihood
Wiuf, Carsten, 1 nov. 2006, I: Journal of Mathematical Biology. 53, 5, s. 821-841 21 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Inference on Recombination and Block Structure Using Unphased Data
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2004, I: Genetics. 166, 1, s. 537-545 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Conditional genealogies and the age of a neutral mutant
Wiuf, Carsten & Donnelly, P., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 56, 2, s. 183-201 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Some notes on the combinatorial properties of haplotype tagging
Wiuf, Carsten, Laidlaw, Z. & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2003, I: Mathematical Biosciences. 185, 2, s. 205-216 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Evolutionary analysis of protein interaction networks
Wiuf, Carsten & Ratmann, O., 1 jan. 2009, Statistical and Evolutionary Analysis of Biological Networks. Imperial College Press, s. 17-43 27 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Recombination as a point process along sequences
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 55, 3, s. 248-259 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research
Wiuf, Carsten & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Oxford University Press. 208 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A reaction network scheme for hidden Markov model parameter learning
Wiuf, Carsten, Behera, A., Singh, A. & Gopalkrishnan, M., 2023, I: Journal of the Royal Society Interface. 20, 203, 20220877.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The probability and chromosomal extent of trans-specific polymorphism
Wiuf, Carsten, Zhao, K., Innan, H. & Nordborg, M., 1 dec. 2004, I: Genetics. 168, 4, s. 2363-2372 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A coalescence approach to gene conversion
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 57, 4, s. 357-367 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The ancestry of a sample of sequences subject to recombination
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 mar. 1999, I: Genetics. 151, 3, s. 1217-1228 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The coalescent with gene conversion
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 maj 2000, I: Genetics. 155, 1, s. 451-462 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A coalescent model of recombination hotspots
Wiuf, Carsten & Posada, D., 1 maj 2003, I: Genetics. 164, 1, s. 407-417 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Some properties of the conditioned reconstructed process with Bernoulli sampling
Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Theoretical Population Biology. 122, s. 36-45 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Methods for derivation of LOH and allelic copy numbers using SNP arrays
Wiuf, Carsten, Lamy, P. & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University Press, Bind 9780199532872.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
On the number of ancestors to a DNA sequence
Wiuf, Carsten & Hein, J., 1 nov. 1997, I: Genetics. 147, 3, s. 1459-1468 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Binomial subsampling
Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2006, I: Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences. 462, 2068, s. 1181-1195 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Inferring population history from genealogical trees
Wiuf, Carsten, 1 mar. 2003, I: Journal of Mathematical Biology. 46, 3, s. 241-264 24 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A simulation study of the reliability of recombination detection methods
Wiuf, Carsten, Christensen, T. & Hein, J., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 10, s. 1929-1939 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Recombination in human mitochondrial DNA?
Wiuf, Carsten, 17 nov. 2001, I: Genetics. 159, 2, s. 749-756 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
On the minimum number of topologies explaining a sample of DNA sequences
Wiuf, Carsten, 1 dec. 2002, I: Theoretical Population Biology. 62, 4, s. 357-363 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Rare alleles and selection
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2001, I: Theoretical Population Biology. 59, 4, s. 287-296 10 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A likelihood approach to analysis of network data
Wiuf, Carsten, Brameier, M., Hagberg, O. & Stumpf, M. P. H., 16 maj 2006, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 20, s. 7566-7570 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Algebraic Statistics and Methods in Systems Biology
Wiuf, Carsten, 12 sep. 2011, Handbook of Statistical Systems Biology. Wiley, s. 114-132 19 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
On the genealogy of a sample of neutral rare alleles
Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 58, 1, s. 61-75 15 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Do ΔF508 heterozygotes have a selective advantage?
Wiuf, Carsten, 29 aug. 2001, I: Genetical Research. 78, 1, s. 41-47 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
High-resolution melting analysis for mutation screening of RGSL1, RGS16, and RGS8 in breast cancer
Wiechec, E., Wiuf, Carsten, Overgaard, J. & Hansen, L. L., 1 feb. 2011, I: Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 20, 2, s. 397-407 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics
Widder, S., Allen, R. J., Pfeiffer, T., Curtis, T. P., Wiuf, C. H., Sloan, W. T., Cordero, O. X., Brown, S. P., Momeni, B., Shou, W., Kettle, H., Flint, H. J., Haas, A. F., Laroche, B., Kreft, J-U., Rainey, P. B., Freilich, S., Schuster, S., Milferstedt, K., van der Meer, J. R. & 10 flere, , 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2557-2568 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data
Wang, K., Li, J., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 9 jan. 2009, I: BMC Bioinformatics. 10, 12.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Identification of hidden population structure in time-scaled phylogenies
Volz, E. M., Wiuf, Carsten, Grad, Y. H., Frost, S. D. W., Dennis, A. M. & Didelot, X., 2020, I: Systematic Biology. 69, 5, s. 884-896Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data
Vincent, M., Mundbjerg, K., Pedersen, J. S., Liang, G., Jones, P. A., Orntoft, T. F., Sorensen, K. D. & Wiuf, Carsten, 21 feb. 2017, I: Genome Biology (Online Edition). 18, 38.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Identification of endogenous retroviral reading frames in the human genome
Villesen, P., Aagaard, L., Wiuf, Carsten & Pedersen, F. S., 11 okt. 2004, I: Retrovirology. 1, 32.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model
Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Genome-wide analysis of allelic imbalance in prostate cancer using the Affymetrix 50K SNP mapping array
Tørring, N., Borre, M., Sørensen, K. D., Andersen, C. L., Wiuf, Carsten & Ørntoft, T. F., 12 feb. 2007, I: British Journal of Cancer. 96, 3, s. 499-506 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer
Toustrup, K., Sørensen, B. S., Nordsmark, M., Busk, M., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 1 sep. 2011, I: Cancer Research. 71, 17, s. 5923-5931 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Gene expression classifier predicts for hypoxic modification of radiotherapy with nimorazole in squamous cell carcinomas of the head and neck
Toustrup, K., Sørensen, B. S., Lassen, P., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 2012, I: Radiotherapy & Oncology. 102, 1, s. 122-129 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes
Tidow, H., Poulsen, L. R., Andreeva, A., Knudsen, M., Hein, K. L., Wiuf, Carsten, Palmgren, Michael & Nissen, P., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 468–472 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis
Thorsen, K., Schepeler, T., Øster, B., Rasmussen, M. H., Vang, S., Wang, K., Hansen, K. Q., Lamy, P., Pedersen, J. S., Eller, A., Mansilla, F., Laurila, K., Wiuf, Carsten, Laurberg, S., Dyrskjøt, L., Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 14 okt. 2011, I: BMC Genomics. 12, 505.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
SNPTools: A software tool for visualization and analysis of microarray data
Sørensen, F. J., Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 15 jun. 2007, I: Bioinformatics. 23, 12, s. 1550-1552 3 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Nonnegative linear elimination for chemical reaction networks
Sáez, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2019, I: SIAM Journal on Applied Mathematics. 79, 6, s. 2434-2455Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Linear elimination in chemical reaction networks
Sáez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2019, Recent Advances in Differential Equations and Applications. Guirao, J. L. G., Hernández, J. A. M. & Esparza, F. P. (red.). Springer, s. 177-193 17 s. (SEMA SIMAI Springer Series, Bind 18).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
ID: 36080139
Flest downloads
-
1287
downloads
Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
292
downloads
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
257
downloads
Identifying parameter regions for multistationarity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet