Carsten Wiuf

Carsten Wiuf

Professor

ORCID: 0000-0002-1302-4445

Udgivelsesår:
Alle
51 - 100 ud af 149Pr. side: 50
Sortering: 1. forfatter
  1. Udgivet

    Estimating the size of the human interactome

    Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. Subnets of scale-free networks are not scale-free: Sampling properties of networks

    Stumpf, M. P. H., Wiuf, Carsten & May, R. M., 22 mar. 2005, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102, 12, s. 4221-4224 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. Incomplete and noisy network data as a percolation process

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 6 okt. 2010, I: Journal of the Royal Society Interface. 7, 51, s. 1411-1419 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  4. Sampling properties of random graphs: The degree distribution

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2005, I: Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics. 72, 3, 036118.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Statistical and evolutionary analysis of biological networks

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt

  6. Statistical model selection methods applied to biological networks

    Stumpf, M. P. H., Ingram, P. J., Nouvel, I. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2005, Transactions on Computational systems Biology III. s. 65-77 13 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 3737 LNBI).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  7. Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks

    Stumpf, M. P. H., Kelly, W. P., Thorne, T. & Wiuf, Carsten, 1 jul. 2007, I: Trends in Ecology and Evolution. 22, 7, s. 366-373 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  8. Recombination analysis using directed graphical models [4]

    Strimmer, K., Wiuf, Carsten & Moulton, V., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 1, s. 97-99 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics

    Soraggi, S. & Wiuf, Carsten, 2019, I: Theoretical Population Biology. 125, s. 56-66 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. Udgivet

    Powerful Inference With the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data

    Soraggi, S., Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 2, s. 551-566

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. Udgivet

    A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models

    Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  12. The Coalescent of Bacterial Populations

    Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species

    Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 1, s. 195–237

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Graphical criteria for positive solutions to linear systems

    Saez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2018, I: Linear Algebra and Its Applications. 552, s. 166-193

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe

    Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, Breuer, R., Czerski, P. M., Giegling, I., Strengman, E., Schmael, C., Mors, O., Mortensen, P. B., Hougaard, D. M., Orntoft, T., Kapelski, P., Priebe, L., Basmanav, F. B., Forstner, A. J., Hoffmann, P. F. F., Meier, S., Nikitopoulos, J., Moebus, S., Alexander, M., Mössner, R., Wichmann, H., Schreiber, S., Rivandeneira, F., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Wienker, T. F., Schumacher, J., Hauser, J., Maier, W., Cantor, R., Erk, S., Schulze, T. G., Stefansson, H., Steinberg, S., Gustafsson, O., Sigurdsson, E., Petursson, H., Kong, A., Stefansson, K., Pietiläinen, O. P. H., Tuulio-Henriksson, A., Paunio, T., Lonnqvist, J., Suvisaari, J., Peltonen, L., Ruggeri, M., Tosato, S., Walshe, M., Murray, R., Collier, D. A., Clair, D. S., Hansen, T., Ingason, A., Jakobsen, K. D., Duong, L., Werge, T., Melle, I., Andreassen, O. A., Djurovic, S., Bitter, I., Réthelyi, J. M., Abramova, L., Kaleda, V., Golimbet, V., Jönsson, E. G., Terenius, L., Agartz, I., Winkel, R. V., Kenis, G., Hert, M. D., Veldink, J., Wiuf, Carsten, Didriksen, M., Craddock, N., Owen, M. J., O'Donovan, M. C., Børglum, A., Rujescu, D., Walter, H., Meyer-Lindenberg, A., Nöthen, M. M., Ophoff, R. A. & Cichon, S., 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers

    Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10576-10581 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Using likelihood-free inference to compare evolutionary dynamics of the protein networks of H. pylori and P. falciparum

    Ratmann, O., Jørgensen, O., Hinkley, T., Stumpf, M., Richardson, S. & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2007, I: PLOS Computational Biology. 3, 11, s. 2266-2278 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  19. From evidence to inference: Probing the evolution of protein interaction networks

    Ratmann, O., Wiuf, Carsten & Pinney, J. W., 1 okt. 2009, I: HFSP Journal. 3, 5, s. 290-306 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  21. Udgivet

    Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage

    Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network

    Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Simulating haplotype blocks in the human genome

    Posada, D. & Wiuf, Carsten, 1 feb. 2003, I: Bioinformatics. 19, 2, s. 289-290 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. An algebro-topological description of protein domain structure

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Fatgraph models of proteins

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 1 okt. 2010, I: Communications on Pure and Applied Mathematics. 63, 10, s. 1249-1297 49 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression

    Pedersen, B. P., Ifrim, G., Liboriussen, P., Axelsen, K. B., Palmgren, Michael, Nissen, P., Wiuf, Carsten & Pedersen, C. N. S., 20 jan. 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 11 s., e85139.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. A codon-based model designed to describe lentiviral evolution

    Pedersen, A. M. K., Wiuf, Carsten & Christiansen, F. B., 1 jan. 1998, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 15, 8, s. 1069-1081 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Udgivet

    Parchment Glutamine Index (PQI): A novel method to estimate glutamine deamidation levels in parchment collagen obtained from low-quality MALDI-TOF data

    Anila Bhuvanendran Nair, Bharath, Palomo, I. R., Markussen, Bo, Wiuf, Carsten, Fiddyment, S. & Collins, Matthew James, 2023, I: Peer Community Journal. 3, 18 s., e10.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    Intermediates and Generic Convergence to Equilibria

    Marcondes de Freitas, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Bulletin of Mathematical Biology. 79, 7, s. 1662–1686

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Intermediates, Catalysts, Persistence, and Boundary Steady States

    Marcondes de Freitas, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 4, s. 887–932

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

    Mahdi, A., Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2213-2232

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Germline mutation in RNASEL predicts increased risk of head and neck, uterine cervix and breast cancer

    Madsen, B. E., Ramos, E. M., Boulard, M., Duda, K., Overgaard, J., Nordsmark, M., Wiuf, Carsten & Hansen, L. L., 25 jun. 2008, I: PLOS ONE. 3, 6, e2492.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Short tandem repeats in human exons: A target for disease mutations

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 12 sep. 2008, I: BMC Genomics. 9, 410.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. A periodic pattern of SNPs in the human genome

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2007, I: Genome Research. 17, 10, s. 1414-1419 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Short tandem repeats and genetic variation

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, Genetic Variation: Methods and Protocols. Humana Press, s. 297-306 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 628).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  36. Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin

    Li, J., Wang, K., Jensen, T. D., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 29 nov. 2010, I: BMC Research Notes. 3, 321.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

    Laurila, K., Oster, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, Carsten, 27 maj 2011, I: BMC Bioinformatics. 12, 215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Genotyping and annotation of Affymetrix SNP arrays

    Lamy, P., Andersen, C. L., Wikman, F. P. & Wiuf, Carsten, 21 sep. 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, 14, e100.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. A Hidden Markov Model to estimate population mixture and allelic copy-numbers in cancers using Affymetrix SNP arrays

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjot, L., Torring, N. & Wiuf, Carsten, 9 nov. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 434.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Rseg-an R package to optimize segmentation of SNP array data

    Lamy, P., Wiuf, Carsten, Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 1 feb. 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 419-420 2 s., btq668.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. A review of software for microarray genotyping

    Lamy, P., Grove, J. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2011, I: Human Genomics. 5, 4, s. 304-309 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  42. Are microRNAs located in genomic regions associated with cancer?

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjøt, L., Tørring, N., Ørntoft, T. & Wiuf, Carsten, 20 nov. 2006, I: British Journal of Cancer. 95, 10, s. 1415-1418 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM

    Kristensen, L. S., Wojdacz, T. K., Thestrup, B. B., Wiuf, Carsten, Hager, H. & Hansen, L. L., 21 dec. 2009, I: BMC Cancer. 9, 453.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Phosphorelays provide tunable signal processing capabilities for the cell

    Kothamachu, V. B., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten, Cardelli, L. & Soyer, O. S., 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 11, s. e1003322

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. High-density single nucleotide polymorphism array defines novel stage and location-dependent allelic imbalances in human bladder tumors

    Koed, K., Wiuf, Carsten, Christensen, L. L., Wikman, F. P., Zieger, K., Møller, K., Von Der Maase, H. & Ørntoft, T. F., 1 jan. 2005, I: Cancer Research. 65, 1, s. 34-45 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models

    Knudsen, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 300, s. 7-18 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. A Markov chain approach to randomly grown graphs

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 9 jul. 2008, I: Journal of Applied Mathematics. 2008, 190836.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. The CATH database.

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, I: Human Genomics. 4, 3, s. 207-212 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Phosphorelay of non-orthodox two component systems functions through a bi-molecular mechanism in vivo: the case of ArcB

    Jovanovic, G., Sheng, X., Ale, A., Feliu, Elisenda, Harrington, H. A., Kirk, P., Wiuf, Carsten, Buck, M. & Stumpf, M. P. H., 23 mar. 2015, I: Molecular BioSystems. 11, s. 1348-1359

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Bounded coordinate-descent for biological sequence classification in high dimensional predictor space

    Ifrim, G. & Wiuf, Carsten, 16 sep. 2011, Proceedings of the 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD'11. s. 708-716 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 36080139