Carsten Wiuf
Professor
Institut for Matematiske Fag
Universitetsparken 5
2100 København Ø
- 2013
- Udgivet
A computational method to preclude multistationarity in networks of interacting species
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Bioinformatics. 29, 18, s. 2327-2334Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Phosphorelays provide tunable signal processing capabilities for the cell
Kothamachu, V. B., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten, Cardelli, L. & Soyer, O. S., 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 11, s. e1003322Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Simplifying biochemical models with intermediate species
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of the Royal Society. Interface. 10, 87, s. 20130484Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variable elimination in post-translational modification reaction networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of Mathematical Biology. 66, 1-2, s. 281-310Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2012
- Udgivet
Preclusion of switch behavior in networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2012, I: Applied Mathematics and Computation. 219, 4, s. 1449-1467 19 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes
Tidow, H., Poulsen, L. R., Andreeva, A., Knudsen, M., Hein, K. L., Wiuf, Carsten, Palmgren, Michael & Nissen, P., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 468–472 5 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
An algebraic approach to signaling cascades with N layers
Feliu, Elisenda, Knudsen, M., Andersen, L. N. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Bulletin of Mathematical Biology. 74, 1, s. 45-72 28 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe
Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, , 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Enzyme-sharing as a cause of multi-stationarity in signalling systems
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of the Royal Society. Interface. 9, 71, s. 1224-1232 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models
Knudsen, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 300, s. 7-18 12 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Gene expression classifier predicts for hypoxic modification of radiotherapy with nimorazole in squamous cell carcinomas of the head and neck
Toustrup, K., Sørensen, B. S., Lassen, P., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 2012, I: Radiotherapy & Oncology. 102, 1, s. 122-129 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Modelling the contribution of family history and variation in single nucleotide polymorphisms to risk of schizophrenia: a Danish national birth cohort-based study
Agerbo, E., Mortensen, P. B., Wiuf, Carsten, Pedersen, M. S., McGrath, J., Hollegaard, M. V., Nørgaard-Pedersen, B., Hougaard, D. M., Mors, O. & Pedersen, C. B., 2012, I: Schizophrenia Research. 134, 2-3, s. 246-252 7 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Signaling cascades: consequences of varying substrate and phosphatase levels
Feliu, Elisenda, Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Advances in Experimental Medicine and Biology. 736, s. 81-94 14 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- Udgivet
Variable elimination in chemical reaction networks with mass-action kinetics
Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 72, 4, s. 959–981 23 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2011
Utilization of computer science for construction and characterization of DNA nano-structures
Andersen, F. F., Villesen, P., Knudsen, B., Wiuf, Carsten, Desideri, A. & Knudsen, B. R., 1 dec. 2011, DNA Microarrays, Synthesis and Synthetic DNA. Nova Science Publishers, s. 317-330 14 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis
Thorsen, K., Schepeler, T., Øster, B., Rasmussen, M. H., Vang, S., Wang, K., Hansen, K. Q., Lamy, P., Pedersen, J. S., Eller, A., Mansilla, F., Laurila, K., Wiuf, Carsten, Laurberg, S., Dyrskjøt, L., Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 14 okt. 2011, I: BMC Genomics. 12, 505.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Bounded coordinate-descent for biological sequence classification in high dimensional predictor space
Ifrim, G. & Wiuf, Carsten, 16 sep. 2011, Proceedings of the 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD'11. s. 708-716 9 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt
Algebraic Statistics and Methods in Systems Biology
Wiuf, Carsten, 12 sep. 2011, Handbook of Statistical Systems Biology. Wiley, s. 114-132 19 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers
Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer
Toustrup, K., Sørensen, B. S., Nordsmark, M., Busk, M., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 1 sep. 2011, I: Cancer Research. 71, 17, s. 5923-5931 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis
Laurila, K., Oster, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, Carsten, 27 maj 2011, I: BMC Bioinformatics. 12, 215.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
An algebro-topological description of protein domain structure
Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
High-resolution melting analysis for mutation screening of RGSL1, RGS16, and RGS8 in breast cancer
Wiechec, E., Wiuf, Carsten, Overgaard, J. & Hansen, L. L., 1 feb. 2011, I: Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 20, 2, s. 397-407 11 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Rseg-an R package to optimize segmentation of SNP array data
Lamy, P., Wiuf, Carsten, Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 1 feb. 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 419-420 2 s., btq668.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A review of software for microarray genotyping
Lamy, P., Grove, J. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2011, I: Human Genomics. 5, 4, s. 304-309 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
- 2010
Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin
Li, J., Wang, K., Jensen, T. D., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 29 nov. 2010, I: BMC Research Notes. 3, 321.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Incomplete and noisy network data as a percolation process
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 6 okt. 2010, I: Journal of the Royal Society Interface. 7, 51, s. 1411-1419 9 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt
Fatgraph models of proteins
Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 1 okt. 2010, I: Communications on Pure and Applied Mathematics. 63, 10, s. 1249-1297 49 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The Coalescent of Bacterial Populations
Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison
Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt
Short tandem repeats and genetic variation
Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, Genetic Variation: Methods and Protocols. Humana Press, s. 297-306 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 628).Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
The CATH database.
Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, I: Human Genomics. 4, 3, s. 207-212 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
- 2009
Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM
Kristensen, L. S., Wojdacz, T. K., Thestrup, B. B., Wiuf, Carsten, Hager, H. & Hansen, L. L., 21 dec. 2009, I: BMC Cancer. 9, 453.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network
Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
From evidence to inference: Probing the evolution of protein interaction networks
Ratmann, O., Wiuf, Carsten & Pinney, J. W., 1 okt. 2009, I: HFSP Journal. 3, 5, s. 290-306 17 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Methods for derivation of LOH and allelic copy numbers using SNP arrays
Wiuf, Carsten, Lamy, P. & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University Press, Bind 9780199532872.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Preface
Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University PressPublikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Forord/efterskrift › Forskning
Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research
Wiuf, Carsten & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Oxford University Press. 208 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
Genome-wide scans using archived neonatal dried blood spot samples
Hollegaard, M. V., Grauholm, J., Børglum, A., Nyegaard, M., Nørgaard-Pedersen, B., Ørntoft, T., Mortensen, P. B., Wiuf, Carsten, Mors, O., Didriksen, M., Thorsen, P. & Hougaard, D. M., 4 jul. 2009, I: BMC Genomics. 10, 297.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution
Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10576-10581 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The genealogy, site frequency spectrum and ages of two nested mutant alleles
Hobolth, A. & Wiuf, Carsten, 1 jun. 2009, I: Theoretical Population Biology. 75, 4, s. 260-265 6 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer
Zieger, K., Wiuf, Carsten, Jensen, K. M. E., Ørntoft, T. & Dyrskjøt, L., 16 maj 2009, I: BMC Cancer. 9, 149.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data
Wang, K., Li, J., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 9 jan. 2009, I: BMC Bioinformatics. 10, 12.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Evolutionary analysis of protein interaction networks
Wiuf, Carsten & Ratmann, O., 1 jan. 2009, Statistical and Evolutionary Analysis of Biological Networks. Imperial College Press, s. 17-43 27 s.Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt
Statistical and evolutionary analysis of biological networks
Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Forskning › fagfællebedømt
- 2008
Clonal evolution in t(14;18)-positive follicular lymphoma, evidence for multiple common pathways, and frequent parallel clonal evolution
D'Amore, F., Chan, E., Iqbal, J., Geng, H., Young, K., Xiao, L., Hess, M. M., Sanger, W. G., Smith, L., Wiuf, Carsten, Hagberg, O., Fu, K., Chan, W. C. & Dave, B. J., 15 nov. 2008, I: Clinical Cancer Research. 14, 22, s. 7180-7187 8 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Short tandem repeats in human exons: A target for disease mutations
Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 12 sep. 2008, I: BMC Genomics. 9, 410.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
A Markov chain approach to randomly grown graphs
Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 9 jul. 2008, I: Journal of Applied Mathematics. 2008, 190836.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Germline mutation in RNASEL predicts increased risk of head and neck, uterine cervix and breast cancer
Madsen, B. E., Ramos, E. M., Boulard, M., Duda, K., Overgaard, J., Nordsmark, M., Wiuf, Carsten & Hansen, L. L., 25 jun. 2008, I: PLOS ONE. 3, 6, e2492.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
The association between genetic variants in hMLH1 and hMSH2 and the development of sporadic colorectal cancer in the Danish population
Christensen, L. L., Madsen, B. E., Wikman, F. P., Wiuf, Carsten, Koed, K., Tjønneland, A., Olsen, A., Syvänen, A. C., Andersen, C. L. & Ørntoft, T. F., 11 jun. 2008, I: BMC Medical Genetics. 9, 52.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
ID: 36080139
Flest downloads
-
1287
downloads
Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
292
downloads
Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet -
258
downloads
Identifying parameter regions for multistationarity
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt
Udgivet