Carsten Wiuf

Carsten Wiuf

Professor

ORCID: 0000-0002-1302-4445

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 149Pr. side: 50
Sortering: Titel

  1. A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

    Laurila, K., Oster, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, Carsten, 27 maj 2011, I: BMC Bioinformatics. 12, 215.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  2. A Hidden Markov Model to estimate population mixture and allelic copy-numbers in cancers using Affymetrix SNP arrays

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjot, L., Torring, N. & Wiuf, Carsten, 9 nov. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 434.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. A Markov chain approach to randomly grown graphs

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 9 jul. 2008, I: Journal of Applied Mathematics. 2008, 190836.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  4. Udgivet

    A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models

    Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes

    Tidow, H., Poulsen, L. R., Andreeva, A., Knudsen, M., Hein, K. L., Wiuf, Carsten, Palmgren, Michael & Nissen, P., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 468–472 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › fagfællebedømt

  6. A coalescence approach to gene conversion

    Wiuf, Carsten, 1 jan. 2000, I: Theoretical Population Biology. 57, 4, s. 357-367 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. A coalescent model of recombination hotspots

    Wiuf, Carsten & Posada, D., 1 maj 2003, I: Genetics. 164, 1, s. 407-417 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. A codon-based model designed to describe lentiviral evolution

    Pedersen, A. M. K., Wiuf, Carsten & Christiansen, F. B., 1 jan. 1998, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 15, 8, s. 1069-1081 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    A computational method to preclude multistationarity in networks of interacting species

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Bioinformatics. 29, 18, s. 2327-2334

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. A likelihood approach to analysis of network data

    Wiuf, Carsten, Brameier, M., Hagberg, O. & Stumpf, M. P. H., 16 maj 2006, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 103, 20, s. 7566-7570 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  11. A periodic pattern of SNPs in the human genome

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2007, I: Genome Research. 17, 10, s. 1414-1419 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    A proof of unlimited multistability for phosphorylation cycles

    Feliu, Elisenda, Rendall, A. D. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Nonlinearity. 33, s. 5629–5658

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    A reaction network scheme for hidden Markov model parameter learning

    Wiuf, Carsten, Behera, A., Singh, A. & Gopalkrishnan, M., 2023, I: Journal of the Royal Society Interface. 20, 203, 20220877.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. A review of software for microarray genotyping

    Lamy, P., Grove, J. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2011, I: Human Genomics. 5, 4, s. 304-309 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

  15. A simulation study of the reliability of recombination detection methods

    Wiuf, Carsten, Christensen, T. & Hein, J., 1 jan. 2001, I: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION . 18, 10, s. 1929-1939 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  16. Ab initio identification of human microRNAs based on structure motifs

    Brameier, M. & Wiuf, Carsten, 18 dec. 2007, I: BMC Bioinformatics. 8, 478.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Addition of flow reactions preserving multistationarity and bistability

    Cappelletti, D., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2020, I: Mathematical Biosciences. 320, 8 s., 108295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. Algebraic Statistics and Methods in Systems Biology

    Wiuf, Carsten, 12 sep. 2011, Handbook of Statistical Systems Biology. Wiley, s. 114-132 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  19. Udgivet

    An algebraic approach to signaling cascades with N layers

    Feliu, Elisenda, Knudsen, M., Andersen, L. N. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Bulletin of Mathematical Biology. 74, 1, s. 45-72 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. An algebro-topological description of protein domain structure

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. Are microRNAs located in genomic regions associated with cancer?

    Lamy, P., Andersen, C. L., Dyrskjøt, L., Tørring, N., Ørntoft, T. & Wiuf, Carsten, 20 nov. 2006, I: British Journal of Cancer. 95, 10, s. 1415-1418 4 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  22. Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe

    Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, Breuer, R., Czerski, P. M., Giegling, I., Strengman, E., Schmael, C., Mors, O., Mortensen, P. B., Hougaard, D. M., Orntoft, T., Kapelski, P., Priebe, L., Basmanav, F. B., Forstner, A. J., Hoffmann, P. F. F., Meier, S., Nikitopoulos, J., Moebus, S., Alexander, M., Mössner, R., Wichmann, H., Schreiber, S., Rivandeneira, F., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Wienker, T. F., Schumacher, J., Hauser, J., Maier, W., Cantor, R., Erk, S., Schulze, T. G., Stefansson, H., Steinberg, S., Gustafsson, O., Sigurdsson, E., Petursson, H., Kong, A., Stefansson, K., Pietiläinen, O. P. H., Tuulio-Henriksson, A., Paunio, T., Lonnqvist, J., Suvisaari, J., Peltonen, L., Ruggeri, M., Tosato, S., Walshe, M., Murray, R., Collier, D. A., Clair, D. S., Hansen, T., Ingason, A., Jakobsen, K. D., Duong, L., Werge, T., Melle, I., Andreassen, O. A., Djurovic, S., Bitter, I., Réthelyi, J. M., Abramova, L., Kaleda, V., Golimbet, V., Jönsson, E. G., Terenius, L., Agartz, I., Winkel, R. V., Kenis, G., Hert, M. D., Veldink, J., Wiuf, Carsten, Didriksen, M., Craddock, N., Owen, M. J., O'Donovan, M. C., Børglum, A., Rujescu, D., Walter, H., Meyer-Lindenberg, A., Nöthen, M. M., Ophoff, R. A. & Cichon, S., 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Binomial subsampling

    Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 1 jan. 2006, I: Proceedings of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences. 462, 2068, s. 1181-1195 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Bioinformatic identification of FGF, p38-MAPK, and calcium signalling pathways associated with carcinoma in situ in the urinary bladder

    Herbsleb, M., Christensen, O. F., Thykjaer, T., Wiuf, Carsten, Borre, M., Ørntoft, T. F. & Dyrskjøt, L., 31 jan. 2008, I: BMC Cancer. 8, 37.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Bounded coordinate-descent for biological sequence classification in high dimensional predictor space

    Ifrim, G. & Wiuf, Carsten, 16 sep. 2011, Proceedings of the 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD'11. s. 708-716 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Cellular compartments cause multistability and allow cells to process more information

    Harrington, H. A., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 16 apr. 2013, I: Biophysical Journal. 104, 8, s. 1824-1831 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. Udgivet

    Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics

    Widder, S., Allen, R. J., Pfeiffer, T., Curtis, T. P., Wiuf, C. H., Sloan, W. T., Cordero, O. X., Brown, S. P., Momeni, B., Shou, W., Kettle, H., Flint, H. J., Haas, A. F., Laroche, B., Kreft, J-U., Rainey, P. B., Freilich, S., Schuster, S., Milferstedt, K., van der Meer, J. R. & 10 flere, Groβkopf, T., Huisman, J., Free, A., Picioreanu, C., Quince, C., Klapper, I., Labarthe, S., Smets, B. F., Wang, H. & Soyer, O. S., 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2557-2568 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  28. Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer

    Zieger, K., Wiuf, Carsten, Jensen, K. M. E., Ørntoft, T. & Dyrskjøt, L., 16 maj 2009, I: BMC Cancer. 9, 149.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  29. Clonal evolution in t(14;18)-positive follicular lymphoma, evidence for multiple common pathways, and frequent parallel clonal evolution

    D'Amore, F., Chan, E., Iqbal, J., Geng, H., Young, K., Xiao, L., Hess, M. M., Sanger, W. G., Smith, L., Wiuf, Carsten, Hagberg, O., Fu, K., Chan, W. C. & Dave, B. J., 15 nov. 2008, I: Clinical Cancer Research. 14, 22, s. 7180-7187 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Co-clustering and visualization of gene expression data and gene ontology terms for Saccharomyces cerevisiae using self-organizing maps

    Brameier, M. & Wiuf, Carsten, 1 apr. 2007, I: Journal of Biomedical Informatics. 40, 2, s. 160-173 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Coalescent models derived from birth–death processes

    Crespo, F. F., Posada, D. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Theoretical Population Biology. 142, s. 1-11

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers

    Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  33. Conditional genealogies and the age of a neutral mutant

    Wiuf, Carsten & Donnelly, P., 1 jan. 1999, I: Theoretical Population Biology. 56, 2, s. 183-201 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Conflicting results in SNP genotype assessment

    Hansen, L. L., Madsen, B. E., Pedersen, K. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2007, I: BioTechniques. 43, 6, s. 756-762 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

    Mahdi, A., Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2213-2232

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Consistency of estimators of population scaled parameters using composite likelihood

    Wiuf, Carsten, 1 nov. 2006, I: Journal of Mathematical Biology. 53, 5, s. 821-841 21 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Convergence properties of the degree distribution of some growing network models

    Hagberg, O. & Wiuf, Carsten, 1 aug. 2006, I: Bulletin of Mathematical Biology. 68, 6, s. 1275-1291 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. Udgivet

    Core signalling motif displaying multistability through multi-state enzymes

    Feng, S., Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten, Feliu, Elisenda & Soyer, O. S., okt. 2016, I: Journal of the Royal Society. Interface. 13, 123, 20160524.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  39. Udgivet

    Critical Parameters for Singular Perturbation Reductions of Chemical Reaction Networks

    Feliu, Elisenda, Walcher, S. & Wiuf, Carsten, dec. 2022, I: Journal of Nonlinear Science. 32, 6, 41 s., 83.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer

    Toustrup, K., Sørensen, B. S., Nordsmark, M., Busk, M., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 1 sep. 2011, I: Cancer Research. 71, 17, s. 5923-5931 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Do ΔF508 heterozygotes have a selective advantage?

    Wiuf, Carsten, 29 aug. 2001, I: Genetical Research. 78, 1, s. 41-47 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Elimination of intermediate species in multiscale stochastic reaction networks

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2016, I: Annals of Applied Probability. 26, 5, s. 2915-2958 44 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Enzyme-sharing as a cause of multi-stationarity in signalling systems

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of the Royal Society. Interface. 9, 71, s. 1224-1232 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Estimating admixture pedigrees of recent hybrids without a contiguous reference genome

    Garcia Erill, Genís, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Heller, Rasmus, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 7, s. 1604-1619 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Estimating the size of the human interactome

    Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. Udgivet

    Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage

    Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  47. Udgivet

    Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies

    van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data

    Wang, K., Li, J., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 9 jan. 2009, I: BMC Bioinformatics. 10, 12.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model

    Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Evolution at the system level: the natural history of protein interaction networks

    Stumpf, M. P. H., Kelly, W. P., Thorne, T. & Wiuf, Carsten, 1 jul. 2007, I: Trends in Ecology and Evolution. 22, 7, s. 366-373 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 36080139