Carsten Wiuf

Carsten Wiuf

Professor

ORCID: 0000-0002-1302-4445

Udgivelsesår:
Alle
1 - 50 ud af 148Pr. side: 50
Sortering: Udgivelsesdato
  1. 2024
  2. Udgivet

    Maximum likelihood estimation and natural pairwise estimating equations are identical for three sequences and a symmetric 2-state substitution model

    Hobolth, A. & Wiuf, Carsten, 2024, I: Theoretical Population Biology. 156, s. 1-4

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    A reaction network scheme for hidden Markov model parameter learning

    Wiuf, Carsten, Behera, A., Singh, A. & Gopalkrishnan, M., 2023, I: Journal of the Royal Society Interface. 20, 203, 20220877.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  5. Udgivet

    Estimating admixture pedigrees of recent hybrids without a contiguous reference genome

    Garcia Erill, Genís, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Heller, Rasmus, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 7, s. 1604-1619 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  6. Udgivet

    Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model

    Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  7. Udgivet

    Full classification of dynamics for one-dimensional continuous-Time Markov chains with polynomial transition rates

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2023, I: Advances in Applied Probability. 55, 1, s. 321-355

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  8. Udgivet

    On the sum of chemical reactions

    Hoessly, Linard David, Wiuf, Carsten & Xia, P., 2023, I: European Journal of Applied Mathematics. 34, 2, s. 303-325 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  9. Udgivet

    Parchment Glutamine Index (PQI): A novel method to estimate glutamine deamidation levels in parchment collagen obtained from low-quality MALDI-TOF data

    Anila Bhuvanendran Nair, Bharath, Palomo, I. R., Markussen, Bo, Wiuf, Carsten, Fiddyment, S. & Collins, Matthew James, 2023, I: Peer Community Journal. 3, 18 s., e10.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  10. 2022
  11. Udgivet

    Critical Parameters for Singular Perturbation Reductions of Chemical Reaction Networks

    Feliu, Elisenda, Walcher, S. & Wiuf, Carsten, dec. 2022, I: Journal of Nonlinear Science. 32, 6, 41 s., 83.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  12. Udgivet

    Estimation of site frequency spectra from low-coverage sequencing data using stochastic EM reduces overfitting, runtime, and memory usage

    Rasmussen, Malthe Sebro, Garcia Erill, Genís, Korneliussen, Thorfinn Sand, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2022, I: Genetics. 222, 4, 15 s., iyac148.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  13. Udgivet

    Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies

    van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  14. Udgivet

    Fast reactions with non-interacting species in stochastic reaction networks

    Hoessly, Linard David & Wiuf, Carsten, 2022, I: Mathematical Biosciences and Engineering. 19, 3, s. 2720-2749

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  15. Udgivet

    Parchment Glutamine Index (PQI): A novel method to estimate glutamine deamidation levels in parchment collagen obtained from low-quality MALDI-TOF data

    Anila Bhuvanendran Nair, Bharath, Palomo, I. R., Markussen, Bo, Wiuf, Carsten, Fiddyment, S. & Collins, Matthew James, 2022, bioRxiv, 18 s.

    Publikation: Working paper › Forskning › fagfællebedømt

  16. Udgivet

    Quasi-steady state and singular perturbation reduction for reaction networks with non-interacting species

    Feliu, Elisenda, Lax, C., Walcher, S. & Wiuf, Carsten, 2022, I: SIAM Journal on Applied Dynamical Systems. 21, 2, s. 782–816

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  17. Udgivet

    Structural classification of continuous time Markov chains with applications

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Stochastics. 94, 7, s. 1003-1030

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  18. 2021
  19. Udgivet

    Coalescent models derived from birth–death processes

    Crespo, F. F., Posada, D. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Theoretical Population Biology. 142, s. 1-11

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  20. Udgivet

    The dynamics of stochastic mono-molecular reaction systems in stochastic environments

    Cappelletti, D., Pal Majumder, A. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Stochastic Processes and Their Applications. 137, s. 106-148

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  21. 2020
  22. Udgivet

    Existence of a unique quasi-stationary distribution in stochastic reaction networks

    Christian Hansen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2020, I: Electronic Journal of Probability. 25, 30 s., 45.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  23. Udgivet

    A proof of unlimited multistability for phosphorylation cycles

    Feliu, Elisenda, Rendall, A. D. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Nonlinearity. 33, s. 5629–5658

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  24. Udgivet

    Addition of flow reactions preserving multistationarity and bistability

    Cappelletti, D., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2020, I: Mathematical Biosciences. 320, 8 s., 108295.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  25. Udgivet

    Identification of hidden population structure in time-scaled phylogenies

    Volz, E. M., Wiuf, Carsten, Grad, Y. H., Frost, S. D. W., Dennis, A. M. & Didelot, X., 2020, I: Systematic Biology. 69, 5, s. 884-896

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  26. Udgivet

    Stationary distributions of systems with discreteness-induced transitions

    Bibbona, E., Kim, J. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Journal of the Royal Society Interface. 17, 168, 11 s., 20200243.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  27. 2019
  28. Udgivet

    A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models

    Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferencebidrag i proceedings › Forskning › fagfællebedømt

  29. Udgivet

    General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics

    Soraggi, S. & Wiuf, Carsten, 2019, I: Theoretical Population Biology. 125, s. 56-66 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  30. Udgivet

    Linear elimination in chemical reaction networks

    Sáez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2019, Recent Advances in Differential Equations and Applications. Guirao, J. L. G., Hernández, J. A. M. & Esparza, F. P. (red.). Springer, s. 177-193 17 s. (SEMA SIMAI Springer Series, Bind 18).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › fagfællebedømt

  31. Udgivet

    Nonnegative linear elimination for chemical reaction networks

    Sáez, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2019, I: SIAM Journal on Applied Mathematics. 79, 6, s. 2434-2455

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  32. 2018
  33. Udgivet

    Graphical criteria for positive solutions to linear systems

    Saez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2018, I: Linear Algebra and Its Applications. 552, s. 166-193

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  34. Udgivet

    Node balanced steady states: Unifying and generalizing complex and detailed balanced steady states

    Feliu, Elisenda, Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Mathematical Biosciences. 301, s. 68-82

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  35. Udgivet

    Some properties of the conditioned reconstructed process with Bernoulli sampling

    Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Theoretical Population Biology. 122, s. 36-45 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  36. Udgivet

    On the Liouville integrability of Edelstein's reaction system in R3

    Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 1 mar. 2018, I: Chaos, Solitons and Fractals. 108, s. 129-135 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  37. Udgivet

    Powerful Inference With the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data

    Soraggi, S., Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 2, s. 551-566

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  38. 2017
  39. Udgivet

    Identifying parameter regions for multistationarity

    Conradi, C., Feliu, Elisenda, Mincheva, M. & Wiuf, Carsten, 13 aug. 2017, I: P L o S Computational Biology (Online). 13, 10, 25 s., e1005751.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  40. Udgivet

    epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data

    Vincent, M., Mundbjerg, K., Pedersen, J. S., Liang, G., Jones, P. A., Orntoft, T. F., Sorensen, K. D. & Wiuf, Carsten, 21 feb. 2017, I: Genome Biology (Online Edition). 18, 38.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  41. Udgivet

    Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

    Mahdi, A., Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2213-2232

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  42. Udgivet

    Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species

    Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 1, s. 195–237

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  43. Udgivet

    Intermediates and Generic Convergence to Equilibria

    Marcondes de Freitas, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Bulletin of Mathematical Biology. 79, 7, s. 1662–1686

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  44. Udgivet

    Intermediates, Catalysts, Persistence, and Boundary Steady States

    Marcondes de Freitas, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 4, s. 887–932

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  45. Udgivet

    Uniform Approximation of Solutions by Elimination of Intermediate Species in Deterministic Reaction Networks

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2259-2286

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  46. 2016
  47. Udgivet

    Elimination of intermediate species in multiscale stochastic reaction networks

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2016, I: Annals of Applied Probability. 26, 5, s. 2915-2958 44 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  48. Udgivet

    Core signalling motif displaying multistability through multi-state enzymes

    Feng, S., Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten, Feliu, Elisenda & Soyer, O. S., okt. 2016, I: Journal of the Royal Society. Interface. 13, 123, 20160524.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  49. Udgivet

    LandScape: a simple method to aggregate p-values and other stochastic variables without a priori grouping

    Wiuf, Carsten, Pallesen, J. S., Foldager, L. & Grove, J., aug. 2016, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 15, 4, s. 349-361

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  50. Udgivet

    Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics

    Widder, S., Allen, R. J., Pfeiffer, T., Curtis, T. P., Wiuf, C. H., Sloan, W. T., Cordero, O. X., Brown, S. P., Momeni, B., Shou, W., Kettle, H., Flint, H. J., Haas, A. F., Laroche, B., Kreft, J-U., Rainey, P. B., Freilich, S., Schuster, S., Milferstedt, K., van der Meer, J. R. & 10 flere, Groβkopf, T., Huisman, J., Free, A., Picioreanu, C., Quince, C., Klapper, I., Labarthe, S., Smets, B. F., Wang, H. & Soyer, O. S., 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2557-2568 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  51. Udgivet

    Product-Form Poisson-Like Distributions and Complex Balanced Reaction Systems

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2016, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 76, 1, s. 411-432

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  52. 2015
  53. Udgivet

    Phosphorelay of non-orthodox two component systems functions through a bi-molecular mechanism in vivo: the case of ArcB

    Jovanovic, G., Sheng, X., Ale, A., Feliu, Elisenda, Harrington, H. A., Kirk, P., Wiuf, Carsten, Buck, M. & Stumpf, M. P. H., 23 mar. 2015, I: Molecular BioSystems. 11, s. 1348-1359

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  54. Udgivet

    Finding the positive feedback loops underlying multi-stationarity

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2015, I: B M C Systems Biology. 9, 22.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  55. Udgivet

    Lyapunov Functions, Stationary Distributions, and Non-equilibrium Potential for Reaction Networks

    Anderson, D. F., Craciun, G., Gopalkrishnan , M. & Wiuf, Carsten, 2015, I: Bulletin of Mathematical Biology. 77, 9, s. 1744-1767

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  56. 2014
  57. Udgivet

    Genome-wide study of association and interaction with maternal cytomegalovirus infection suggests new schizophrenia loci

    Børglum, A. D., Demontis, D., Grove, J., Pallesen, J., Hollegaard, M. V., Pedersen, C. B., Hedemand, A., Mattheisen, M., Uitterlinden, A., Nyegaard, M., Ørntoft, T., Wiuf, C. H., Didriksen, M., Nordentoft, M., Nöthen, M. M., Rietschel, M., Ophoff, R. A., Cichon, S., Yolken, R. H., Hougaard, D. M. & 3 flere, Mortensen, P. B., Mors, O. & GROUP investigators10, G. I., mar. 2014, I: Molecular Psychiatry. 19, 3, s. 325-333 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  58. Udgivet

    Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression

    Pedersen, B. P., Ifrim, G., Liboriussen, P., Axelsen, K. B., Palmgren, Michael, Nissen, P., Wiuf, Carsten & Pedersen, C. N. S., 20 jan. 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 11 s., e85139.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  59. 2013
  60. Udgivet

    Power-Law Kinetics and Determinant Criteria for the Preclusion of Multistationarity in Networks of Interacting Species

    Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 16 okt. 2013, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 12, 4, s. 1685-1721 37 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  61. Udgivet

    Cellular compartments cause multistability and allow cells to process more information

    Harrington, H. A., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 16 apr. 2013, I: Biophysical Journal. 104, 8, s. 1824-1831 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

  62. Udgivet

    A computational method to preclude multistationarity in networks of interacting species

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Bioinformatics. 29, 18, s. 2327-2334

    Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 36080139