Carsten Wiuf

Carsten Wiuf

Professor


  1. 2024
  2. Udgivet

    Maximum likelihood estimation and natural pairwise estimating equations are identical for three sequences and a symmetric 2-state substitution model

    Hobolth, A. & Wiuf, Carsten, 2024, I: Theoretical Population Biology. 156, s. 1-4

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. 2023
  4. Udgivet

    A reaction network scheme for hidden Markov model parameter learning

    Wiuf, Carsten, Behera, A., Singh, A. & Gopalkrishnan, M., 2023, I: Journal of the Royal Society Interface. 20, 203, 20220877.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Estimating admixture pedigrees of recent hybrids without a contiguous reference genome

    Garcia Erill, Genís, Hanghøj, Kristian Ebbesen, Heller, Rasmus, Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 7, s. 1604-1619 16 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Evaluation of population structure inferred by principal component analysis or the admixture model

    Van Waaij, J., Li, Song, Garcia Erill, Genís, Albrechtsen, Anders & Wiuf, Carsten, 2023, I: Genetics. 225, 2, 14 s., iyad157.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Full classification of dynamics for one-dimensional continuous-Time Markov chains with polynomial transition rates

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2023, I: Advances in Applied Probability. 55, 1, s. 321-355

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    On the sum of chemical reactions

    Hoessly, Linard David, Wiuf, Carsten & Xia, P., 2023, I: European Journal of Applied Mathematics. 34, 2, s. 303-325 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Parchment Glutamine Index (PQI): A novel method to estimate glutamine deamidation levels in parchment collagen obtained from low-quality MALDI-TOF data

    Anila Bhuvanendran Nair, Bharath, Palomo, I. R., Markussen, Bo, Wiuf, Carsten, Fiddyment, S. & Collins, Matthew James, 2023, I: Peer Community Journal. 3, 18 s., e10.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. 2022
  11. Udgivet

    Critical Parameters for Singular Perturbation Reductions of Chemical Reaction Networks

    Feliu, Elisenda, Walcher, S. & Wiuf, Carsten, dec. 2022, I: Journal of Nonlinear Science. 32, 6, 41 s., 83.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet
  13. Udgivet

    Estimation of the covariance structure from SNP allele frequencies

    van Waaij, J., Li, Z. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 21, 1, 20 s., 20220005.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Fast reactions with non-interacting species in stochastic reaction networks

    Hoessly, Linard David & Wiuf, Carsten, 2022, I: Mathematical Biosciences and Engineering. 19, 3, s. 2720-2749

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet
  16. Udgivet

    Quasi-steady state and singular perturbation reduction for reaction networks with non-interacting species

    Feliu, Elisenda, Lax, C., Walcher, S. & Wiuf, Carsten, 2022, I: SIAM Journal on Applied Dynamical Systems. 21, 2, s. 782–816

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Structural classification of continuous time Markov chains with applications

    Xu, C., Hansen, M. C. & Wiuf, Carsten, 2022, I: Stochastics. 94, 7, s. 1003-1030

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. 2021
  19. Udgivet

    Coalescent models derived from birth–death processes

    Crespo, F. F., Posada, D. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Theoretical Population Biology. 142, s. 1-11

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    The dynamics of stochastic mono-molecular reaction systems in stochastic environments

    Cappelletti, D., Pal Majumder, A. & Wiuf, Carsten, 2021, I: Stochastic Processes and Their Applications. 137, s. 106-148

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. 2020
  22. Udgivet

    Existence of a unique quasi-stationary distribution in stochastic reaction networks

    Christian Hansen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2020, I: Electronic Journal of Probability. 25, 30 s., 45.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    A proof of unlimited multistability for phosphorylation cycles

    Feliu, Elisenda, Rendall, A. D. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Nonlinearity. 33, s. 5629–5658

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Addition of flow reactions preserving multistationarity and bistability

    Cappelletti, D., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2020, I: Mathematical Biosciences. 320, 8 s., 108295.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    Identification of hidden population structure in time-scaled phylogenies

    Volz, E. M., Wiuf, Carsten, Grad, Y. H., Frost, S. D. W., Dennis, A. M. & Didelot, X., 2020, I: Systematic Biology. 69, 5, s. 884-896

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Stationary distributions of systems with discreteness-induced transitions

    Bibbona, E., Kim, J. & Wiuf, Carsten, 2020, I: Journal of the Royal Society Interface. 17, 168, 11 s., 20200243.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. 2019
  28. Udgivet

    A Reaction Network Scheme Which Implements Inference and Learning for Hidden Markov Models

    Singh, A., Wiuf, Carsten, Behera, A. & Gopalkrishnan, M., 2019, DNA Computing and Molecular Programming - 25th International Conference, DNA 25, Proceedings. Liu, Y. & Thachuk, C. (red.). Springer, s. 54-79 26 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics), Bind 11648 LNCS).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    General theory for stochastic admixture graphs and F-statistics

    Soraggi, S. & Wiuf, Carsten, 2019, I: Theoretical Population Biology. 125, s. 56-66 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  30. Udgivet

    Linear elimination in chemical reaction networks

    Sáez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2019, Recent Advances in Differential Equations and Applications. Guirao, J. L. G., Hernández, J. A. M. & Esparza, F. P. (red.). Springer, s. 177-193 17 s. (SEMA SIMAI Springer Series, Bind 18).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Nonnegative linear elimination for chemical reaction networks

    Sáez, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2019, I: SIAM Journal on Applied Mathematics. 79, 6, s. 2434-2455

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. 2018
  33. Udgivet

    Graphical criteria for positive solutions to linear systems

    Saez, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2018, I: Linear Algebra and Its Applications. 552, s. 166-193

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Node balanced steady states: Unifying and generalizing complex and detailed balanced steady states

    Feliu, Elisenda, Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Mathematical Biosciences. 301, s. 68-82

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Some properties of the conditioned reconstructed process with Bernoulli sampling

    Wiuf, Carsten, jul. 2018, I: Theoretical Population Biology. 122, s. 36-45 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    On the Liouville integrability of Edelstein's reaction system in R3

    Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 1 mar. 2018, I: Chaos, Solitons and Fractals. 108, s. 129-135 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Powerful Inference With the D-Statistic on Low-Coverage Whole-Genome Data

    Soraggi, S., Wiuf, Carsten & Albrechtsen, Anders, 2018, I: G3: Genes, Genomes, Genetics (Bethesda). 8, 2, s. 551-566

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. 2017
  39. Udgivet

    Identifying parameter regions for multistationarity

    Conradi, C., Feliu, Elisenda, Mincheva, M. & Wiuf, Carsten, 13 aug. 2017, I: P L o S Computational Biology (Online). 13, 10, 25 s., e1005751.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    epiG: statistical inference and profiling of DNA methylation from whole-genome bisulfite sequencing data

    Vincent, M., Mundbjerg, K., Pedersen, J. S., Liang, G., Jones, P. A., Orntoft, T. F., Sorensen, K. D. & Wiuf, Carsten, 21 feb. 2017, I: Genome Biology (Online Edition). 18, 38.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Conservation Laws in Biochemical Reaction Networks

    Mahdi, A., Ferragut, A., Valls, C. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2213-2232

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Graphical reduction of reaction networks by linear elimination of species

    Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 1, s. 195–237

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Intermediates and Generic Convergence to Equilibria

    Marcondes de Freitas, M., Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 2017, I: Bulletin of Mathematical Biology. 79, 7, s. 1662–1686

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Intermediates, Catalysts, Persistence, and Boundary Steady States

    Marcondes de Freitas, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2017, I: Journal of Mathematical Biology. 74, 4, s. 887–932

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Uniform Approximation of Solutions by Elimination of Intermediate Species in Deterministic Reaction Networks

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2017, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 16, 4, s. 2259-2286

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. 2016
  47. Udgivet

    Elimination of intermediate species in multiscale stochastic reaction networks

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 1 okt. 2016, I: Annals of Applied Probability. 26, 5, s. 2915-2958 44 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Core signalling motif displaying multistability through multi-state enzymes

    Feng, S., Saez Cornellana, M., Wiuf, Carsten, Feliu, Elisenda & Soyer, O. S., okt. 2016, I: Journal of the Royal Society. Interface. 13, 123, 20160524.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    LandScape: a simple method to aggregate p-values and other stochastic variables without a priori grouping

    Wiuf, Carsten, Pallesen, J. S., Foldager, L. & Grove, J., aug. 2016, I: Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology. 15, 4, s. 349-361

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Challenges in microbial ecology: building predictive understanding of community function and dynamics

    Widder, S., Allen, R. J., Pfeiffer, T., Curtis, T. P., Wiuf, C. H., Sloan, W. T., Cordero, O. X., Brown, S. P., Momeni, B., Shou, W., Kettle, H., Flint, H. J., Haas, A. F., Laroche, B., Kreft, J-U., Rainey, P. B., Freilich, S., Schuster, S., Milferstedt, K., van der Meer, J. R. & 10 flere, Groβkopf, T., Huisman, J., Free, A., Picioreanu, C., Quince, C., Klapper, I., Labarthe, S., Smets, B. F., Wang, H. & Soyer, O. S., 2016, I: I S M E Journal. 10, 11, s. 2557-2568 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. Udgivet

    Product-Form Poisson-Like Distributions and Complex Balanced Reaction Systems

    Cappelletti, D. & Wiuf, Carsten, 2016, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 76, 1, s. 411-432

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  52. 2015
  53. Udgivet

    Phosphorelay of non-orthodox two component systems functions through a bi-molecular mechanism in vivo: the case of ArcB

    Jovanovic, G., Sheng, X., Ale, A., Feliu, Elisenda, Harrington, H. A., Kirk, P., Wiuf, Carsten, Buck, M. & Stumpf, M. P. H., 23 mar. 2015, I: Molecular BioSystems. 11, s. 1348-1359

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Finding the positive feedback loops underlying multi-stationarity

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2015, I: B M C Systems Biology. 9, 22.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Lyapunov Functions, Stationary Distributions, and Non-equilibrium Potential for Reaction Networks

    Anderson, D. F., Craciun, G., Gopalkrishnan , M. & Wiuf, Carsten, 2015, I: Bulletin of Mathematical Biology. 77, 9, s. 1744-1767

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. 2014
  57. Udgivet

    Genome-wide study of association and interaction with maternal cytomegalovirus infection suggests new schizophrenia loci

    Børglum, A. D., Demontis, D., Grove, J., Pallesen, J., Hollegaard, M. V., Pedersen, C. B., Hedemand, A., Mattheisen, M., Uitterlinden, A., Nyegaard, M., Ørntoft, T., Wiuf, C. H., Didriksen, M., Nordentoft, M., Nöthen, M. M., Rietschel, M., Ophoff, R. A., Cichon, S., Yolken, R. H., Hougaard, D. M. & 3 flere, Mortensen, P. B., Mors, O. & GROUP investigators10, G. I., mar. 2014, I: Molecular Psychiatry. 19, 3, s. 325-333 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  58. Udgivet

    Large scale identification and categorization of protein sequences using structured logistic regression

    Pedersen, B. P., Ifrim, G., Liboriussen, P., Axelsen, K. B., Palmgren, Michael, Nissen, P., Wiuf, Carsten & Pedersen, C. N. S., 20 jan. 2014, I: PLOS ONE. 9, 1, 11 s., e85139.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  59. 2013
  60. Udgivet

    Power-Law Kinetics and Determinant Criteria for the Preclusion of Multistationarity in Networks of Interacting Species

    Wiuf, Carsten & Feliu, Elisenda, 16 okt. 2013, I: S I A M Journal on Applied Dynamical Systems. 12, 4, s. 1685-1721 37 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  61. Udgivet

    Cellular compartments cause multistability and allow cells to process more information

    Harrington, H. A., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten & Stumpf, M. P. H., 16 apr. 2013, I: Biophysical Journal. 104, 8, s. 1824-1831 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  62. Udgivet

    A computational method to preclude multistationarity in networks of interacting species

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Bioinformatics. 29, 18, s. 2327-2334

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  63. Udgivet

    Phosphorelays provide tunable signal processing capabilities for the cell

    Kothamachu, V. B., Feliu, Elisenda, Wiuf, Carsten, Cardelli, L. & Soyer, O. S., 2013, I: P L o S Computational Biology (Online). 9, 11, s. e1003322

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  64. Udgivet

    Simplifying biochemical models with intermediate species

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of the Royal Society. Interface. 10, 87, s. 20130484

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  65. Udgivet

    Variable elimination in post-translational modification reaction networks with mass-action kinetics

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2013, I: Journal of Mathematical Biology. 66, 1-2, s. 281-310

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  66. 2012
  67. Udgivet

    Preclusion of switch behavior in networks with mass-action kinetics

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 1 nov. 2012, I: Applied Mathematics and Computation. 219, 4, s. 1449-1467 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  68. Udgivet

    A bimodular mechanism of calcium control in eukaryotes

    Tidow, H., Poulsen, L. R., Andreeva, A., Knudsen, M., Hein, K. L., Wiuf, Carsten, Palmgren, Michael & Nissen, P., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 468–472 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  69. Udgivet

    An algebraic approach to signaling cascades with N layers

    Feliu, Elisenda, Knudsen, M., Andersen, L. N. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Bulletin of Mathematical Biology. 74, 1, s. 45-72 28 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  70. Association between genetic variation in a region on chromosome 11 and schizophrenia in large samples from Europe

    Rietschel, M., Mattheisen, M., Degenhardt, F., Kahn, R. S., Linszen, D. H., Os, J. V., Wiersma, D., Bruggeman, R., Cahn, W., de Haan, L., Krabbendam, L., Myin-Germeys, I., Mühleisen, T. W., Kirsch, P., Esslinger, C., Herms, S., Demontis, D., Steffens, M., Strohmaier, J., Haenisch, B. & 82 flere, Breuer, R., Czerski, P. M., Giegling, I., Strengman, E., Schmael, C., Mors, O., Mortensen, P. B., Hougaard, D. M., Orntoft, T., Kapelski, P., Priebe, L., Basmanav, F. B., Forstner, A. J., Hoffmann, P. F. F., Meier, S., Nikitopoulos, J., Moebus, S., Alexander, M., Mössner, R., Wichmann, H., Schreiber, S., Rivandeneira, F., Hofman, A., Uitterlinden, A. G., Wienker, T. F., Schumacher, J., Hauser, J., Maier, W., Cantor, R., Erk, S., Schulze, T. G., Stefansson, H., Steinberg, S., Gustafsson, O., Sigurdsson, E., Petursson, H., Kong, A., Stefansson, K., Pietiläinen, O. P. H., Tuulio-Henriksson, A., Paunio, T., Lonnqvist, J., Suvisaari, J., Peltonen, L., Ruggeri, M., Tosato, S., Walshe, M., Murray, R., Collier, D. A., Clair, D. S., Hansen, T., Ingason, A., Jakobsen, K. D., Duong, L., Werge, T., Melle, I., Andreassen, O. A., Djurovic, S., Bitter, I., Réthelyi, J. M., Abramova, L., Kaleda, V., Golimbet, V., Jönsson, E. G., Terenius, L., Agartz, I., Winkel, R. V., Kenis, G., Hert, M. D., Veldink, J., Wiuf, Carsten, Didriksen, M., Craddock, N., Owen, M. J., O'Donovan, M. C., Børglum, A., Rujescu, D., Walter, H., Meyer-Lindenberg, A., Nöthen, M. M., Ophoff, R. A. & Cichon, S., 2012, I: Molecular Psychiatry. 17, 9, s. 906-917 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  71. Udgivet

    Enzyme-sharing as a cause of multi-stationarity in signalling systems

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of the Royal Society. Interface. 9, 71, s. 1224-1232 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  72. Udgivet

    Exact analysis of intrinsic qualitative features of phosphorelays using mathematical models

    Knudsen, M., Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: Journal of Theoretical Biology. 300, s. 7-18 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  73. Gene expression classifier predicts for hypoxic modification of radiotherapy with nimorazole in squamous cell carcinomas of the head and neck

    Toustrup, K., Sørensen, B. S., Lassen, P., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 2012, I: Radiotherapy & Oncology. 102, 1, s. 122-129 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  74. Udgivet

    Modelling the contribution of family history and variation in single nucleotide polymorphisms to risk of schizophrenia: a Danish national birth cohort-based study

    Agerbo, E., Mortensen, P. B., Wiuf, Carsten, Pedersen, M. S., McGrath, J., Hollegaard, M. V., Nørgaard-Pedersen, B., Hougaard, D. M., Mors, O. & Pedersen, C. B., 2012, I: Schizophrenia Research. 134, 2-3, s. 246-252 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  75. Udgivet

    Signaling cascades: consequences of varying substrate and phosphatase levels

    Feliu, Elisenda, Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 2012, I: Advances in Experimental Medicine and Biology. 736, s. 81-94 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  76. Udgivet

    Variable elimination in chemical reaction networks with mass-action kinetics

    Feliu, Elisenda & Wiuf, Carsten, 2012, I: S I A M Journal on Applied Mathematics. 72, 4, s. 959–981 23 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  77. 2011
  78. Utilization of computer science for construction and characterization of DNA nano-structures

    Andersen, F. F., Villesen, P., Knudsen, B., Wiuf, Carsten, Desideri, A. & Knudsen, B. R., 1 dec. 2011, DNA Microarrays, Synthesis and Synthetic DNA. Nova Science Publishers, s. 317-330 14 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  79. Tumor-specific usage of alternative transcription start sites in colorectal cancer identified by genome-wide exon array analysis

    Thorsen, K., Schepeler, T., Øster, B., Rasmussen, M. H., Vang, S., Wang, K., Hansen, K. Q., Lamy, P., Pedersen, J. S., Eller, A., Mansilla, F., Laurila, K., Wiuf, Carsten, Laurberg, S., Dyrskjøt, L., Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 14 okt. 2011, I: BMC Genomics. 12, 505.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  80. Bounded coordinate-descent for biological sequence classification in high dimensional predictor space

    Ifrim, G. & Wiuf, Carsten, 16 sep. 2011, Proceedings of the 17th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD'11. s. 708-716 9 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportKonferencebidrag i proceedingsForskningfagfællebedømt

  81. Algebraic Statistics and Methods in Systems Biology

    Wiuf, Carsten, 12 sep. 2011, Handbook of Statistical Systems Biology. Wiley, s. 114-132 19 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  82. Comprehensive genome methylation analysis in bladder cancer: Identification and validation of novel methylated genes and application of these as urinary tumor markers

    Reinert, T., Modin, C., Castano, F. M., Lamy, P., Wojdacz, T. K., Hansen, L. L., Wiuf, Carsten, Borre, M., Dyrskjøt, L. & Ørntoft, T. F., 1 sep. 2011, I: Clinical Cancer Research. 17, 17, s. 5582-5592 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  83. Development of a hypoxia gene expression classifier with predictive impact for hypoxic modification of radiotherapy in head and neck cancer

    Toustrup, K., Sørensen, B. S., Nordsmark, M., Busk, M., Wiuf, Carsten, Alsner, J. & Overgaard, J., 1 sep. 2011, I: Cancer Research. 71, 17, s. 5923-5931 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  84. A Beta-mixture model for dimensionality reduction, sample classification and analysis

    Laurila, K., Oster, B., Andersen, C. L., Lamy, P., Orntoft, T., Yli-Harja, O. & Wiuf, Carsten, 27 maj 2011, I: BMC Bioinformatics. 12, 215.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  85. An algebro-topological description of protein domain structure

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 27 maj 2011, I: PLoS ONE. 6, 5, e19670.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  86. High-resolution melting analysis for mutation screening of RGSL1, RGS16, and RGS8 in breast cancer

    Wiechec, E., Wiuf, Carsten, Overgaard, J. & Hansen, L. L., 1 feb. 2011, I: Cancer Epidemiology Biomarkers and Prevention. 20, 2, s. 397-407 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  87. Rseg-an R package to optimize segmentation of SNP array data

    Lamy, P., Wiuf, Carsten, Ørntoft, T. F. & Andersen, C. L., 1 feb. 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 419-420 2 s., btq668.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  88. A review of software for microarray genotyping

    Lamy, P., Grove, J. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2011, I: Human Genomics. 5, 4, s. 304-309 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  89. 2010
  90. Tumor heterogeneity in neoplasms of breast, colon, and skin

    Li, J., Wang, K., Jensen, T. D., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 29 nov. 2010, I: BMC Research Notes. 3, 321.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  91. Incomplete and noisy network data as a percolation process

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 6 okt. 2010, I: Journal of the Royal Society Interface. 7, 51, s. 1411-1419 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  92. Fatgraph models of proteins

    Penner, R. C., Knudsen, M., Wiuf, Carsten & Andersen, J. E., 1 okt. 2010, I: Communications on Pure and Applied Mathematics. 63, 10, s. 1249-1297 49 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  93. The Coalescent of Bacterial Populations

    Schierup, M. H. & Wiuf, Carsten, 9 apr. 2010, Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Wiley, s. 1-18 18 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  94. Reply to Robert et al. Model criticism informs model choice and model comparison

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 19 jan. 2010, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107, 3

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  95. Short tandem repeats and genetic variation

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, Genetic Variation: Methods and Protocols. Humana Press, s. 297-306 10 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 628).

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  96. The CATH database.

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2010, I: Human Genomics. 4, 3, s. 207-212 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  97. 2009
  98. Quality assessment of DNA derived from up to 30 years old formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue for PCR-based methylation analysis using SMART-MSP and MS-HRM

    Kristensen, L. S., Wojdacz, T. K., Thestrup, B. B., Wiuf, Carsten, Hager, H. & Hansen, L. L., 21 dec. 2009, I: BMC Cancer. 9, 453.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  99. Temporal development and collapse of an Arctic plant-pollinator network

    Pradal, C., Olesen, J. M. & Wiuf, Carsten, 1 dec. 2009, I: BMC Ecology. 9, 24.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  100. From evidence to inference: Probing the evolution of protein interaction networks

    Ratmann, O., Wiuf, Carsten & Pinney, J. W., 1 okt. 2009, I: HFSP Journal. 3, 5, s. 290-306 17 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  101. Methods for derivation of LOH and allelic copy numbers using SNP arrays

    Wiuf, Carsten, Lamy, P. & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University Press, Bind 9780199532872.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  102. Preface

    Andersen, C. L. & Wiuf, Carsten, 1 sep. 2009, Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research. Oxford University Press

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportForord/efterskriftForskning

  103. Statistics and Informatics in Molecular Cancer Research

    Wiuf, Carsten & Andersen, C. L., 1 sep. 2009, Oxford University Press. 208 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  104. Genome-wide scans using archived neonatal dried blood spot samples

    Hollegaard, M. V., Grauholm, J., Børglum, A., Nyegaard, M., Nørgaard-Pedersen, B., Ørntoft, T., Mortensen, P. B., Wiuf, Carsten, Mors, O., Didriksen, M., Thorsen, P. & Hougaard, D. M., 4 jul. 2009, I: BMC Genomics. 10, 297.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  105. Model criticism based on likelihood-free inference, with an application to protein network evolution

    Ratmann, O., Andrieu, C., Wiuf, Carsten & Richardson, S., 30 jun. 2009, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 26, s. 10576-10581 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  106. The genealogy, site frequency spectrum and ages of two nested mutant alleles

    Hobolth, A. & Wiuf, Carsten, 1 jun. 2009, I: Theoretical Population Biology. 75, 4, s. 260-265 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  107. Chromosomal imbalance in the progression of high-risk non-muscle invasive bladder cancer

    Zieger, K., Wiuf, Carsten, Jensen, K. M. E., Ørntoft, T. & Dyrskjøt, L., 16 maj 2009, I: BMC Cancer. 9, 149.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  108. Estimation of tumor heterogeneity using CGH array data

    Wang, K., Li, J., Li, S., Bolund, L. & Wiuf, Carsten, 9 jan. 2009, I: BMC Bioinformatics. 10, 12.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  109. Evolutionary analysis of protein interaction networks

    Wiuf, Carsten & Ratmann, O., 1 jan. 2009, Statistical and Evolutionary Analysis of Biological Networks. Imperial College Press, s. 17-43 27 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  110. Statistical and evolutionary analysis of biological networks

    Stumpf, M. P. H. & Wiuf, Carsten, 1 jan. 2009, Imperial College Press. 170 s.

    Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportBogForskningfagfællebedømt

  111. 2008
  112. Clonal evolution in t(14;18)-positive follicular lymphoma, evidence for multiple common pathways, and frequent parallel clonal evolution

    D'Amore, F., Chan, E., Iqbal, J., Geng, H., Young, K., Xiao, L., Hess, M. M., Sanger, W. G., Smith, L., Wiuf, Carsten, Hagberg, O., Fu, K., Chan, W. C. & Dave, B. J., 15 nov. 2008, I: Clinical Cancer Research. 14, 22, s. 7180-7187 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  113. Short tandem repeats in human exons: A target for disease mutations

    Madsen, B. E., Villesen, P. & Wiuf, Carsten, 12 sep. 2008, I: BMC Genomics. 9, 410.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  114. A Markov chain approach to randomly grown graphs

    Knudsen, M. & Wiuf, Carsten, 9 jul. 2008, I: Journal of Applied Mathematics. 2008, 190836.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  115. Germline mutation in RNASEL predicts increased risk of head and neck, uterine cervix and breast cancer

    Madsen, B. E., Ramos, E. M., Boulard, M., Duda, K., Overgaard, J., Nordsmark, M., Wiuf, Carsten & Hansen, L. L., 25 jun. 2008, I: PLOS ONE. 3, 6, e2492.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  116. The association between genetic variants in hMLH1 and hMSH2 and the development of sporadic colorectal cancer in the Danish population

    Christensen, L. L., Madsen, B. E., Wikman, F. P., Wiuf, Carsten, Koed, K., Tjønneland, A., Olsen, A., Syvänen, A. C., Andersen, C. L. & Ørntoft, T. F., 11 jun. 2008, I: BMC Medical Genetics. 9, 52.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  117. Udgivet

    Estimating the size of the human interactome

    Stumpf, M. P. H., Thorne, T., De Silva, E., Stewart, R., Hyeong, J. A., Lappe, M. & Wiuf, Carsten, 13 maj 2008, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105, 19, s. 6959-6964 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 Næste

ID: 36080139